蛋白质抗体结构与相互作用数据集ProteinAntibodyStructureandInteractionDataset-nayan082
数据来源:互联网公开数据
标签:蛋白质结构, 抗体, 结构生物学, 相互作用, PDB, X射线衍射, 序列, 二级结构, 数据挖掘
数据概述:
该数据集包含来自结构生物学数据库的数据,记录了蛋白质与抗体相互作用的结构信息。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标注时间,可视为结构快照数据集。
地理范围:数据来源于全球范围内的蛋白质结构研究,涵盖多种物种和实验数据。
数据维度:包括蛋白质数据库编号(pdb_id)、链代码(chain_code)、氨基酸序列(seq)、二级结构信息(sst8 和 sst3)、抗体序列(antibody)、序列长度(len)、是否存在非标准氨基酸(has_nonstd_aa)、实验方法(Exptl)、分辨率(resolution)、R因子(R-factor)和自由R值(FreeRvalue)等。
数据格式:CSV格式,文件名为2018-06-06-pdb-intersect-pisces-antibody3.csv,便于数据分析和处理。
来源信息:数据来源于蛋白质数据库(PDB)等公开数据库,经过结构生物学研究人员的整理和处理,包含了抗体与蛋白质相互作用的关键结构信息。
该数据集适用于蛋白质结构分析、抗体设计、药物研发等领域的研究。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于结构生物学、生物信息学等领域的研究,如蛋白质-抗体相互作用机制分析、抗体结构与功能关系研究等。
行业应用:可以为生物制药、生物技术企业提供数据支持,特别是在抗体药物研发、靶点识别、药物设计等领域。
决策支持:支持药物研发过程中的靶标选择、先导化合物筛选和优化等决策。
教育和培训:作为结构生物学、生物信息学等相关课程的辅助材料,帮助学生和研究人员深入理解蛋白质-抗体相互作用的结构基础。
此数据集特别适合用于探索抗体结合位点与蛋白质结构之间的关系,以及不同抗体对同一靶标的结合差异,从而加速药物研发进程,提高药物设计的效率。