蛋白质突变预测机器学习数据集ProteinMutationPredictionMachineLearningDataset-sgreiner

蛋白质突变预测机器学习数据集ProteinMutationPredictionMachineLearningDataset-sgreiner

数据来源:互联网公开数据

标签:蛋白质结构, 氨基酸突变, 机器学习, 蛋白质预测, 结构生物学, 预测模型, 蛋白质工程, 数据挖掘

数据概述: 该数据集包含蛋白质突变相关的预测数据,记录了蛋白质序列在特定突变下的预测结果。主要特征如下: 时间跨度:数据未明确标注时间,可视为静态的蛋白质结构与突变预测结果。 地理范围:数据覆盖范围取决于蛋白质结构数据库中的蛋白质来源,通常为全球范围内。 数据维度:数据集包含多个关键字段,如pdbid(蛋白质数据库标识符)、chainid(链标识符)、variant(突变类型)、wt_idx(野生型氨基酸位置)、mt_idx(突变型氨基酸位置)、wt_nlf(野生型nlf)、mt_nlf(突变型nlf)、score_ml_fermi(fermi模型预测得分)、score_ml(机器学习模型预测得分)、pos(氨基酸位置)、wt_AA(野生型氨基酸)、mt_AA(突变型氨基酸)以及wt(野生型)。 数据格式:数据以CSV格式提供,文件名为cavity_pred_CUSTOM_A.csv,便于数据分析和模型构建。数据经过了预处理和整理,可以直接用于机器学习模型的训练和评估。 该数据集主要用于蛋白质结构与功能的研究,以及基于机器学习的蛋白质性质预测。

数据用途概述: 该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景: 研究与分析:适用于结构生物学、蛋白质工程和计算生物学等领域的研究,例如蛋白质稳定性预测、突变对蛋白质结构影响的研究。 行业应用:为生物制药、生物技术公司提供数据支持,用于药物设计、蛋白质改造等。 决策支持:支持蛋白质工程领域的决策制定,如优化蛋白质设计、提高蛋白质表达效率等。 教育和培训:作为生物信息学、机器学习等课程的辅助材料,帮助学生和研究人员深入理解蛋白质结构与功能的关系。 此数据集特别适合用于探索氨基酸突变对蛋白质性质的影响,以及构建预测蛋白质功能的机器学习模型,从而加速药物研发和蛋白质工程的进程。

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版本 1.0
最后更新 五月 1, 2025, 09:57 (UTC)
创建于 五月 1, 2025, 09:57 (UTC)
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