蛋白质突变与稳定性预测训练数据集ProteinMutationStabilityPredictionTrainingDataset-w2508524051
数据来源:互联网公开数据
标签:蛋白质结构, 蛋白质突变, 蛋白稳定性, 机器学习, 结构生物学, 序列分析, ddG预测, 数据挖掘
数据概述:
该数据集包含来自蛋白质结构与功能研究的数据,记录了蛋白质突变对其稳定性的影响。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标明时间,可视为静态蛋白质突变与稳定性关系的集合。
地理范围:数据来源于蛋白质结构数据库,涵盖多种蛋白质,无特定地理范围限制。
数据维度:数据集包含以下关键字段:
PDB:蛋白质数据库(Protein Data Bank)编号,用于标识蛋白质结构。
wildtype:蛋白质的野生型氨基酸序列。
position:突变发生的氨基酸残基位置。
mutation:突变的氨基酸残基。
ddG:突变引起的蛋白质自由能变化(ddG)值,反映蛋白质稳定性变化。
sequence:蛋白质的氨基酸序列。
mutant_seq:突变后的氨基酸序列。
source:数据来源标识。
dTm:蛋白质熔解温度变化,反映蛋白质热稳定性变化(部分数据缺失)。
CIF:CIF(Crystallographic Information File)文件标识(部分数据缺失)。
数据格式:CSV格式,文件名为all_train_data_v17.csv,便于数据处理与分析。
来源信息:数据来源于蛋白质结构与功能研究,已进行结构化整理。
该数据集适合用于蛋白质结构与功能研究、蛋白质稳定性预测等领域的数据分析和模型构建。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于蛋白质结构与功能、蛋白质工程等领域的学术研究,如蛋白质稳定性预测模型的构建、突变对蛋白质结构影响的分析等。
行业应用:为生物制药、生物技术公司提供数据支持,用于蛋白质药物的设计与优化、酶的定向进化等。
决策支持:支持蛋白质工程领域的决策制定,例如,辅助设计更稳定的蛋白质,提高蛋白质药物的疗效。
教育和培训:作为结构生物学、生物信息学等课程的辅助材料,帮助学生和研究人员深入理解蛋白质突变与稳定性的关系。
此数据集特别适合用于探索蛋白质突变与稳定性的量化关系,帮助用户实现蛋白质稳定性预测模型的构建、优化蛋白质设计等目标。