单细胞转录组测序Kmers特征数据集-细胞基因表达分析

单细胞转录组测序Kmers特征数据集-细胞基因表达分析 数据来源:互联网公开数据 标签:单细胞,转录组,Kmers,基因表达,RNA片段,细胞特征,生物信息学 数据概述: 本数据集基于单细胞转录组测序数据,通过Kmers技术提取细胞特异性特征。数据集的核心在于将每个细胞表示为特定RNA片段的近似丰度集合。原始数据集通常包含(Ncells, Ngenes)的维度,表示Ncells个细胞中Ngenes个基因的表达量。Kmers数据集则包含(Ngenes, Nkmers)的维度,描述了Ngenes个基因中Nkmers个Kmers(短序列片段)的分布情况。通过将这两个数据集进行矩阵乘法运算,可得到一个(Ncells, Nkmers)的矩阵,该矩阵表征了每个细胞中Kmers的表达特征,从而揭示细胞间的差异。

数据用途概述: 该数据集主要用于单细胞转录组数据的分析,包括细胞类型鉴定、细胞状态分析、基因表达模式探索等。研究人员可以利用该数据集进行聚类分析,将细胞分组,并探索不同细胞群体的Kmers表达差异,从而深入理解细胞的分子机制。此外,该数据集也适用于开发和验证新的单细胞数据分析算法,以及进行生物标志物筛选。

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数据与资源

附加信息

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版本 1.0
数据集大小 212.71 MiB
最后更新 2025年6月1日
创建于 2025年6月1日
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