DEKOIS2_0_for_KarmaDock_虚拟筛选目标蛋白与化合物库数据集

数据集概述

本数据集为DEKOIS 2.0版本，用于虚拟筛选任务。针对每个目标，提供蛋白质结构PDB文件、化合物库SMILES文件及Glide对接构象，以压缩包形式存储，支持药物发现领域的虚拟筛选研究。

文件详解

• 文件名称：DEKOIS2.zip
• 文件格式：ZIP
• 字段映射介绍：压缩包内包含每个目标对应的三类文件：蛋白质结构的PDB文件、化合物库的SMILES文件、Glide-docked poses文件（具体字段需解压后查看原始文件结构）

适用场景

• 药物虚拟筛选研究：用于基于结构的虚拟筛选，评估化合物与目标蛋白的结合潜力
• 分子对接模型验证：作为基准数据集，验证KarmaDock等分子对接工具的性能
• 化合物库筛选分析：利用SMILES文件开展化合物库的结构活性关系研究
• 蛋白质结构与配体相互作用分析：结合PDB文件和对接构象，探究蛋白-配体结合模式