数据集概述
本数据集为论文《The density-based many-body expansion for polypeptides and proteins》的配套数据，包含用于测试计算的结构文件、绘图脚本及输入脚本，支持复现论文中的计算与图表生成。
文件详解
- 压缩包文件
- 文件名称：dataset-zenodo-v2.zip
- 文件格式：ZIP
- 包含目录及内容：
- 01_structures目录：存放所有测试计算用结构的PDB文件（质子化结构）
- 02_plot_scripts目录：存放生成论文中所有图表的Jupyter Notebook及原始数值数据
- 03_input_scripts目录：存放PyADF输入脚本，包括singlepoint.pyadf（多肽与蛋白质单点计算）、dbmfccmbe.pyadf（eb-MFCC、eb-MFCC-MBE(2)、db-MFCC、db-MFCC-MBE(2)计算）
数据来源
论文"The density-based many-body expansion for polypeptides and proteins"（TU Braunschweig, Germany）
适用场景
- 多肽与蛋白质计算化学研究：支持密度基多体展开方法的应用与验证
- 计算结果复现：用于复现论文中的测试计算及图表生成
- 计算化学脚本开发：参考PyADF输入脚本设计多肽与蛋白质相关计算流程
- 结构数据分析：基于PDB文件开展多肽与蛋白质结构特征研究
