数据集概述
本数据集包含Dikarya真菌中cerato-platanin蛋白家族的分布与生物信息分析结果，涉及55个真菌基因组（27个子囊菌门、28个担子菌门）的130个同源蛋白序列。数据涵盖蛋白序列、系统发育分析比对文件、图表及图例，揭示该家族在不同真菌类群中的分布特征、序列保守性及进化关系。
文件详解
- 蛋白序列与比对文件
- 文件名称：All cerato-platanin mature proteins.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含所有cerato-platanin成熟蛋白的序列信息
- 文件名称：All cerato-platanin mature proteins alignments for phylogenetic analysis.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：用于系统发育分析的蛋白序列比对结果
- 图表文件
- 文件名称：FIGURE. 1. Distribution of cerato-platanin homologs in Dikarya..tif
- 文件格式：TIF
- 字段映射介绍：展示cerato-platanin同源蛋白在Dikarya中的分布情况
- 文件名称：FIGURE. 2. Neighbor-joining phylogenetic tree of cerato-platanin family proteins from Dikarya. .tif
- 文件格式：TIF
- 字段映射介绍：基于邻接法构建的cerato-platanin家族蛋白系统发育树
- 文件名称：FIGURE. 3. Maximum likelihood phylogenetic tree of cerato-platanin family proteins from Dikarya..tif
- 文件格式：TIF
- 字段映射介绍：基于最大似然法构建的cerato-platanin家族蛋白系统发育树
- 图例文件
- 文件名称：Legends for FIGURE 1-3.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：包含图1至图3的图例说明
数据来源
论文“Distribution and bioinformatic analysis of the cerato-platanin protein family in Dikarya”
适用场景
- 真菌蛋白质家族进化研究: 分析cerato-platanin家族在Dikarya中的分布特征及进化关系
- 蛋白序列保守性分析: 研究该家族蛋白的信号肽、半胱氨酸残基及特征序列的保守性
- 系统发育树构建与分析: 利用比对文件和系统发育树图表，开展真菌分类与进化研究
- 真菌-宿主相互作用机制研究: 基于该家族蛋白的分泌特性，探究其在真菌与宿主互作中的作用
- 生物信息学方法应用: 验证不同系统发育分析方法（邻接法、最大似然法）在蛋白家族研究中的适用性
