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担子菌植物细胞壁分解基因家族数据集
2026年2月15日 30 96 89
数据集概述 本数据集包含44个担子菌门基因组中与植物细胞壁分解相关的42个基因家族的补充表格、蛋白质序列文件、系统发育分析文件及系统发育树文件。数据用于研究不同营养策略真菌的基因组成差异,揭示其分解机制,共101个文件。 文件详解 补充表格文件...
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转座子防御_真菌王国_遗传因素_支持性数据
2026年2月1日 30 148 26
数据集概述 本数据集为真菌界转座子防御系统遗传因素系统筛选研究的支持信息,包含15张补充表格,覆盖1239个真菌基因组组装的元数据、重复序列分析、系统发育信号、基因共线性、蛋白质结构域、k-mer频率及关联映射等核心内容,用于解析真菌转座子防御系统的遗传基础。 文件详解 代码文件 文件名称:kmer_analysis.py 文件格式:.py...
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内生真菌_Genome_野生生菜内生真菌基因组序列数据
2026年2月9日 30 138 45
数据集概述 本数据集包含从栽培生菜的野生近缘种——野莴苣(Lactuca serriola)中分离出的5种内生真菌的基因组序列数据,共6个文件,主要为基因组注释文件和补充文档,可用于植物内生真菌的基因组学研究。 文件详解 基因组注释文件(.gff格式,共5个)...
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WHUF0304_Based_真菌生物合成基因簇全球分析数据
2026年2月9日 30 60 0
数据集概述 本数据集基于一万三千一百二十五个真菌基因组构建,是目前最全面的真菌生物合成基因簇图谱,聚焦二酮哌嗪生物合成的多样性分析,包含三个相关文件,支持真菌基因组学与生物合成研究。 文件详解 文件名称:Supplementary information.docx 文件格式:DOCX 字段映射介绍:真菌生物合成基因簇全球分析的补充说明文档...
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共生体基因衰变机制与共生基因周转研究数据_基于真菌共生体的收敛损失分析
2026年2月6日 30 22 14
数据集概述 本数据集围绕菌根共生体的基因进化展开,包含13种菌根真菌(外生菌根、兰科菌根、杜鹃花类菌根)和5种腐生真菌的基因组测序分析结果,重点研究基因衰变机制的趋同丢失与共生基因的快速周转,涉及植物细胞壁降解酶基因、共生诱导基因及孤儿基因等核心内容。 文件详解 压缩文件(Archive files)...
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羊肚菌科真菌中新型木材腐朽机制的基因组进化研究数据
2026年1月31日 30 194 39
数据集概述 本数据集包含Agaricales目真菌Fistulina hepatica和Cylindrobasidium torrendii的基因组序列,结合比较基因组学与木材腐朽实验,研究新型木材腐朽机制的演化。数据挑战传统白腐与褐腐二分法,揭示部分真菌的中间型腐朽特征及演化过程,共含6个压缩文件。 文件详解...
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Neurospora_Based_RIP突变分析代码与文件数据集
2026年1月27日 0 78 76
数据集概述 本数据集存储了Neurospora crassa RIP突变分析所用的代码与文件,涵盖基因组突变检测、甲基化定量、Sly1-1突变分析三部分内容,包含研究中使用的序列、注释等相关文件,用于支持该真菌RIP突变的系统性分析。 文件详解 压缩文件 文件名称:zenodo_upload.zip 文件格式:ZIP...
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BioRxiv_Preprint_真菌模拟群落基因组与分类数据_v2
2026年1月26日 30 80 59
数据集概述 本数据集为BioRxiv预印本相关研究数据,包含5种真菌的全基因组组装序列(.fasta格式),以及模拟群落和共生体样本的物种分类结果(.xlsx格式)。分类基于自定义数据库、NCBI RefSeq和SILVA数据库,覆盖5种引物对的扩增子测序数据,支持真菌物种分类与基因组研究。 文件详解 真菌基因组组装文件(.fasta格式,共5个)...
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Dikarya_Cerato_platanin家族分布与生物信息分析数据
2026年1月22日 30 149 0
数据集概述 本数据集包含Dikarya真菌中cerato-platanin蛋白家族的分布与生物信息分析结果,涉及55个真菌基因组(27个子囊菌门、28个担子菌门)的130个同源蛋白序列。数据涵盖蛋白序列、系统发育分析比对文件、图表及图例,揭示该家族在不同真菌类群中的分布特征、序列保守性及进化关系。 文件详解 蛋白序列与比对文件 文件名称:All...
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Phytophthora_Ab_Initio基因模型训练参数JSON数据集
2026年1月21日 30 173 78
数据集概述 本数据集包含二十八个JSON文件,记录疫霉属(Phytophthora)特异性基因模型训练参数,用于从头预测(ab-initio prediction)软件的训练。参数覆盖augustus、genemark等主流基因预测工具,可支持其他相关疫霉属菌株的基因预测与注释工作。 文件详解 JSON参数文件...
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Candida_albicans_Based_白色念珠菌泛基因组研究补充数据
2026年1月20日 30 164 157
数据集概述 本数据集为白色念珠菌泛基因组研究的补充数据,包含五个补充图表和两个补充表格,涉及测序数据质量评估、基因组组装质量、基因数量与长度分布、直系同源群分类及功能注释等内容,支持对白色念珠菌基因组多样性及功能特征的分析。 文件详解 补充图表文件 文件名称:Supplementary Figures S1-S5.docx 文件格式:DOCX...
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GH63_Gene_From_JGI_mycocosm_真菌群落多样性研究数据
2026年1月19日 30 183 101
数据集概述 本数据集围绕真菌群落多样性研究,提供了糖苷水解酶63(GH63)基因的相关序列数据。GH63基因作为新型系统发育标记,用于解决ITS标记存在的比对问题和系统发育分辨率不足的局限,适用于担子菌门等真菌的多样性分析与功能研究。 文件详解 文件名称:GH63_sequences.docx 文件格式:DOCX 字段映射介绍:包含从JGI...
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Nilsson_2017_MycoKeys_真菌DNA序列质量修剪研究补充材料
2026年1月19日 30 138 116
数据集概述 本数据集是论文《公共真菌DNA序列远端的基于读取质量的修剪远未达到令人满意的水平》的补充材料1,包含真菌基因组/重叠群的目标信息。数据以Excel表格形式呈现,用于支持真菌DNA序列质量修剪相关研究,为生物信息学分析提供目标序列的详细背景。 文件详解 文件名称:oo_150049.xlsx 文件格式:XLSX...
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Botryosphaeriaceae_Based真菌进化交配策略致病性基因变异研究数据
2026年1月14日 30 139 92
数据集概述 本数据集为Botryosphaeriaceae科真菌的比较基因组学研究数据,包含271个座囊菌纲物种(含19个Botryosphaeriaceae物种)的基因组分析结果,涉及进化特征、交配策略及致病性相关基因变异等内容,共18个文件,支持真菌分类、致病性进化及交配系统转变的研究。 文件详解 数据表格文件(.xlsx格式,11个)...
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Pyrenophora_teres_hybrid_WAC10721基因组数据_2021
2026年1月14日 30 33 6
数据集概述 本数据集包含Pyrenophora teres hybrid WAC10721的基因组注释、蛋白质功能预测、与参考基因组的直系同源基因分析,以及重复序列、分泌蛋白、效应子和次生代谢物等相关数据,共4个文件,支持真菌基因组学研究。 文件详解 文件名称:Orthologous analysis of P teres...
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fmfi_compbio_Saprochaete_fungicola_CBS_625_85基因组注释数据
2026年1月1日 30 96 79
数据集概述 本数据集为论文“Genome Sequence of an Arthroconidial Yeast Saprochaete fungicola CBS 625.85”配套的基因组组装注释数据,包含sapFunA1基因组的注释信息,以压缩包形式提供,是研究该节分生孢子酵母基因组结构与功能的基础数据。 文件详解 文件名称:fmfi-...
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托比_巴里尔_Toby_Baril_基于小麦真菌病原体Zymoseptoria_tritici的泛基因组资源压缩包_zip文件
2025年12月27日 30 31 12
数据集概述 本数据集是小麦真菌病原体Zymoseptoria tritici的参考级基因组资源集合,包含该病原体的泛基因组相关数据,为研究其基因组特征、进化机制及致病机理提供基础资源支持。 文件详解 文件名称:TobyBaril/Zt_pangenome-v1.0.zip 文件格式:ZIP(压缩包) 字段映射介绍:压缩包内包含Zymoseptoria...
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古生代酶促木质素分解起源重建数据集_31个真菌基因组
2025年12月15日 30 29 26
数据集概述 本数据集围绕31个真菌基因组展开,通过比较分析重建古生代酶促木质素分解的起源,探讨白腐真菌、褐腐真菌及菌根真菌的进化关系,及其与石炭纪末有机碳埋藏速率下降的关联。 文件详解 文件名称:README_for_Supplementary Electronic Files.pdf 文件格式:PDF...
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Podospora_anserina过氧化物酶基因家族特征表1数据集
2025年12月12日 30 66 14
数据集概述 该数据集为《Podospora anserina (Rabenh.) Niessl过氧化物酶基因家族特征》研究中的表1数据,记录了该真菌基因组中过氧化物酶基因的分类、代谢簇、分泌信号、表达水平、结构域及突变标记等核心信息。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 字段映射:...
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Panellus_microspermus新种分子系统发育研究序列分类单元信息表
2025年12月8日 30 60 36
数据集概述 本数据集为“Panellus microspermus sp. nov.”新种分类研究中的序列分类单元信息表,包含研究涉及的各类群标本信息、采集地及GenBank登录号等数据,用于支持该新种的形态与分子系统发育分析。 文件详解 该数据集包含一个HTML格式的文件,具体说明如下: - 文件名称: table.html - 文件格式: HTML...



