数据集概述
本数据集围绕欧洲水生捕食性潜水甲虫（Agabini族）CO1基因序列展开，探究地理采样尺度对DNA条形码目标的影响，包括种内变异估计、遗传距离、物种单系性及物种鉴定性能等方面，为DNA条形码全球应用提供数据支持。
文件详解
- 基因序列与分析文件：
- Agabini_CO1_sequences.nex：NEX格式，包含Agabini族CO1基因序列数据
- Agabini_CO1_species_level_for_dating.nex：NEX格式，物种水平CO1序列数据，用于年代测定
- NJ_tree.nex：NEX格式，邻接树（NJ）分析数据
- bayesian_tree.nex：NEX格式，贝叶斯树分析数据
- 43MPT.nex：NEX格式，43个最简约树（MPT）数据
- beast_chronogram.nex：NEX格式，BEAST时间树分析数据
- 可视化结果文件：
- Suppl_Fig_1_NJ_tree.pdf：PDF格式，补充图1邻接树可视化
- Suppl_Fig_2_parsimony_tree.pdf：PDF格式，补充图2简约树可视化
- Suppl_Fig_3_Bayesian_tree.pdf：PDF格式，补充图3贝叶斯树可视化
- 属性数据文件：
- Agabini_data_w_lat_and_lon.txt：TXT格式，包含样本的分类信息、地理坐标（纬度、经度）及CO1基因相关数据，字段包括BMNH、Family、Subfamily、Genus、Species Name、State、Country、Lat_dec、Lon_dec、CO1、DNA.Plate、DNA.Plate.Well等
适用场景
- 分子生态学研究：分析地理采样尺度对种内遗传变异的影响
- 系统发育分析：基于CO1序列构建物种系统发育树
- 生物多样性研究：评估不同地理尺度下物种鉴定性能
- DNA条形码技术优化：为全球DNA条形码应用的采样策略提供参考
- 进化生物学研究：探究地理因素对物种遗传分化的作用机制
