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标签: 时间树

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  • 来自_物种对全球变化的响应是否可由过去生态位演化预测_研究的数据集

    2026年1月27日 30 105 59

    数据集概述 本数据集围绕欧洲409种鸟类的生态位演化与种群趋势展开,包含物种1970-2000年的种群动态数据、系统发育信息及气候、栖息地、营养生态位数据,旨在探究物种过去的生态位演化速率是否可预测其对全球变化的响应,为生物多样性预测及保护提供支撑。 文件详解 BirdsNicheData_updated.zip 文件格式:ZIP...
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  • Emydidae_Based_新世界池龟系统发育与时间分化研究数据

    2026年1月27日 30 208 104

    数据集概述 本数据集包含新世界池龟科(Emydidae)的综合多基因系统发育树与时间树研究数据,基于30个核基因和4个线粒体基因(共23,330个碱基对)构建,涉及Emydinae亚科所有公认物种及Deirochelyinae亚科各属代表物种,为该类群进化框架与分类学提供支持。 文件详解 核基因数据文件 文件名称:42nuDNAYule.xml...
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  • Dryad_Source_鳞翅目袋蛾科食草植物转变与物种分化研究数据

    2026年1月26日 30 62 17

    数据集概述 本数据集围绕鳞翅目袋蛾科(Mimallonidae)展开,旨在探究食草植物转变对其物种分化的驱动作用。袋蛾科作为隐蔽取食类群,与外部取食的Macroheterocera类群存在显著物种数量差异。数据集提供了袋蛾科的时间树及食草植物关联分析数据,填补了隐蔽取食类群多样性驱动机制的研究空白。 文件详解 补充表格文件(共4个)...
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  • New_Guinea_Based_蜉蝣进化支生物地理学与生态多样化研究数据

    2026年1月21日 30 171 18

    数据集概述 本数据集围绕新几内亚蜉蝣进化支的生物地理学与生态多样化研究构建,包含标本ID原始数据、COI和16s两个线粒体基因的串联比对文件,以及BEAST分析得到的时间树文件,共3个文件,覆盖生物基因研究的核心数据类型。 文件详解 文件名称:locality_data.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Aspidoscelis_线粒体基因组_鞭尾蜥蜴孤雌生殖氨基酸替代率研究数据

    2026年1月20日 30 203 141

    数据集概述 本数据集围绕鞭尾蜥蜴属孤雌生殖与有性生殖物种的线粒体基因组展开研究,通过分析七种孤雌生殖和五种有性生殖物种的全线粒体基因组,验证孤雌生殖导致非同义替代积累的假设。数据集包含基因序列比对、进化模型文件等66个文件,用于支持dN/dS比率估算及相关进化分析。 文件详解 基因序列比对文件 格式:.fasta、.mdsx、.phy...
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  • Ithomiini_Solanaceae_Based蝴蝶分化时间校准研究数据

    2026年1月20日 30 47 8

    数据集概述 本数据集为蝴蝶分化时间研究的补充材料,基于茄科植物时间树的独立校准点,重新分析新热带区Ithomiini蝴蝶的分化时间,对比不同校准方式下的年龄估计差异,探讨蝴蝶与寄主植物进化时间的一致性,为生物进化研究提供参考。 文件详解 文件名称:Supp_Mat_Garzonetal_systbio15.docx 文件格式:DOCX...
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  • Centrarchidae_Source_鲈科鱼类系统发育与多样化时间尺度研究数据

    2026年1月18日 30 105 46

    数据集概述 本数据集聚焦北美淡水鱼类鲈科(Centrarchidae)的系统发育与多样化时间尺度研究,包含16个核基因的DNA序列数据、形态学数据集及化石校准信息,覆盖几乎所有已知及未描述物种,用于解析鲈科鱼类的演化关系与分化时间。 文件详解 基因序列文件(.nex格式,34个)...
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  • Testudines_Phylogenomic_Based_龟类主要分支系统发育时间树分析数据

    2026年1月12日 30 156 149

    数据集概述 本数据集为龟类(Testudines)系统发育基因组分析相关数据,基于539个高信息位点构建龟类主要现存分支的时间树,包含一个压缩文件,用于支持龟类系统发育关系与分化时间的研究。 文件详解 文件名称:539.nex.zip 文件格式:ZIP...
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  • Sargassum_Historical_biogeography_马尾藻属历史生物地理学研究数据集

    2026年1月4日 30 134 108

    数据集概述 本数据集是关于广泛分布的大型藻类马尾藻属(Sargassum)的历史生物地理学研究数据,包含系统发育、分类、序列来源、地理记录及分析输入文件,支持马尾藻属物种的起源、扩散路径及地理分布格局研究。 文件详解 Sargassum_chronogram.tre 文件格式:TRE 内容说明:马尾藻属的时间树文件,记录物种的系统发育关系及分化时间。...
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  • 园丁鸟造亭行为平行演化系统基因组学数据集

    2025年12月23日 30 97 52

    数据集概述 本数据集围绕园丁鸟造亭行为的演化机制展开,通过系统基因组学方法构建物种树,验证单配制猫鸟分支与多配制造亭物种的亲缘关系,探讨造亭行为是祖先性状丢失还是平行演化的结果,为理解这一独特行为的起源提供数据支持。 文件详解 归档文件(.tar格式): alignments_exons.tar:包含5653个外显子位点的比对文件...
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  • 树懒进化历史与生物地理学古线粒体基因组数据集2019

    2025年12月23日 30 199 121

    数据集概述 该数据集是《Current Biology》2019年发表论文的补充材料,包含树懒古线粒体基因组的捕获序列、多格式基因组数据集、系统发育树文件、祖先特征重建结果及实验方案等,为研究树懒的进化历史与生物地理学提供数据支持。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件,具体说明如下: - 序列捕获文件: - Delsuc-...
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  • 北美及夏威夷高倍体紫罗兰物种网络与基因树推断数据集

    2025年12月22日 30 101 78

    数据集概述 本数据集围绕北美及夏威夷高倍体紫罗兰(堇菜属)展开,通过基因树推断物种网络,解决多倍体系统发育无法用二叉树表示的问题。包含基因扩增数据、拓扑冲突分析及最简约物种网络构建结果,支持多倍体进化研究。 文件详解 文件名称: Online_appendix_1_BEAST_input_file.xml 文件格式: XML 内容说明:...
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  • SARS_CoV_2基因组组成结构进化趋势数据集

    2025年12月21日 30 50 31

    数据集概述 本数据集围绕新冠疫情期间SARS-CoV-2基因组组成结构的进化趋势展开,通过计算冠状病毒基因组随机数据集的组成结构指标,揭示其长期下降趋势及进化速率上升的关联,为病毒进化研究提供数据支持。 文件详解 文档类文件: scc_readme.rtf:RTF格式的说明文档,可能包含数据集背景、使用方法等信息...
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  • 高毒性蝾螈自我抗性适应性进化的基因转换研究数据集

    2025年12月18日 30 207 139

    数据集概述 本数据集围绕高毒性蝾螈(Taricha newts)的河豚毒素(TTX)自我抗性进化展开,通过钠通道(Nav)基因家族的测序与分析,探究基因转换在适应性进化中的作用,包含基因序列比对、系统发育树及相关分析文件。 文件详解 序列比对文件(.fasta格式):...
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  • 安乐蜥属现存物种系统发育生物地理学与分类学研究数据集

    2025年12月16日 30 38 12

    数据集概述 本数据集围绕安乐蜥属(Anolis)所有现存物种展开系统发育、生物地理学与分类学研究,涵盖379个物种的系统发育分析数据,含139个物种新系统发育数据及101个物种新DNA数据,为该类群进化研究提供基础。 文件详解 系统发育与生物地理学图表文件: FigS7timetree.pdf:PDF格式,可能为时间树图表,展示安乐蜥属物种进化时间线...
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  • 墨西哥法莱戈尼亚甲虫系统地理学补充材料数据集2023

    2025年12月15日 30 163 99

    数据集概述 本数据集为《墨西哥法莱戈尼亚甲虫(鞘翅目:隐翅虫科: Aleocharinae亚科)的系统地理学》研究的补充材料,包含基于COI基因序列构建的时间树和天际线图,用于支持该研究的系统地理学分析。 文件详解 文件名称: oo_831203.pdf 文件格式: PDF 内容说明:...
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  • 被子植物系统发育平滑参数比例数据集

    2025年12月14日 30 16 0

    数据集概述 该数据集为被子植物大尺度物种水平时间树研究的补充材料,包含针对500个系统发育树复本计算的平滑参数比例数据,支持进化与生态学分析。 文件详解 文件名称: oo_363086.pdf 文件格式: PDF 内容说明: 包含被子植物系统发育分析中500个树复本的平滑参数比例计算结果,为原研究的补充材料3。 数据来源 Biodiversity...
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  • 金鼹与马岛猬系统发育历史的中位数与95_置信区间数据集

    2025年12月11日 30 157 68

    数据集概述 本数据集为金鼹与马岛猬(哺乳纲:非洲兽总目)系统发育历史的分析结果,包含非洲兽总目、马岛猬科及金鼹科各节点的分歧时间中位数与95%置信区间(单位:百万年),基于宽先验分析生成的一致时间树数据。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段映射: Crown node: 冠群节点名称 Plus...
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  • 臭虫科系统发育数据集

    2025年12月8日 30 185 71

    数据集概述 该数据集围绕臭虫科(Cimicidae)的系统发育研究展开,包含基因序列比对文件、单个基因树的贝叶斯分析文档及不同系统发育假设下的时间树图表,为臭虫科的进化关系研究提供数据支持。 文件详解 文件名称:Data Roth_et_al_Alignment_file.txt,文件格式:TXT...
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  • 棕榈科植物全球生物地理学与热带谱系演化数据集

    2025年12月6日 30 141 119

    数据集概述 本数据集围绕棕榈科植物全球生物地理学展开,基于属级时间校准系统发育树与分布数据,通过扩散-灭绝-分支发生模型推断祖先分布区,结合化石记录与分子测年,分析五大亚科时空演化历史,为热带谱系分布机制研究提供支持。 文件详解 文件名称: Baker & Couvreur_raw Lagrange output.txt 文件格式: TXT...
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