数据集概述
本数据集是论文“Towards a better future for DNA barcoding...”的补充文件,包含十四份文件,涉及DNA条形码相关的系统发育树、物种统计、单系性总结和单倍型计数等内容,支持对DNA条形码技术的研究与分析。
文件详解
- 文件类型及示例:
- CSV文件(7个):如Supplemental_file_9_5601taxa_COI3P_speciesstats.csv、Supplemental_file_11_5601taxa_COI5P3P_speciesstats.csv等,包含avg_intra(平均种内距离)、intra_d_max(最大种内距离)、n_intra_comparisons(种内比较次数)、avg_inter(平均种间距离)、inter_dmin_nn(最近邻最小种间距离)、n_inter_comparisons(种间比较次数)、nearest_neighbor(最近邻物种)等字段
- Newick文件(5个):如Supplemental_file_3_5603taxa_COI5Ptree.newick、Supplemental_file_2_5603taxa_COI3Ptree.newick等,为系统发育树文件
- XLSX文件(1个):Supplemental_file_6_monophyly_summary_v2.xlsx,为单系性总结文件
- FASTA文件(1个):Supplemental_file_1_5603taxa_20240118_COI_1493.fasta,为序列文件
数据来源
论文“Towards a better future for DNA barcoding...”
适用场景
- DNA条形码技术研究: 分析DNA条形码序列的种内种间距离,评估其物种鉴定能力
- 系统发育分析: 利用Newick格式的系统发育树文件,研究物种间的进化关系
- 单系性分析: 通过单系性总结文件,探讨物种的单系性特征
- 单倍型研究: 基于单倍型计数文件,分析物种的遗传多样性