找到16个数据集

标签: Newick

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  • Compositae_Target_Enrichment_菊科植物系统发育信息富集方法研究数据

    2026年1月11日 30 56 11

    数据集概述 本数据集来自菊科植物系统发育信息靶向富集方法的研究,包含763个基因位点的系统发育数据、序列长度与数量统计、序列比对文件及比对文件压缩包,可用于菊科植物的系统发育分析与亲缘关系重建。 文件详解 系统发育树文件 文件名称:763_loci_tree_newick 文件格式:无扩展名(Newick格式)...
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  • 系统发育树文件_Newick格式

    2025年12月19日 30 163 150

    数据集概述 本数据集包含以Newick格式存储的系统发育树文件,核心围绕生物学基因相关的进化关系分析,通过压缩包形式提供,便于获取和使用。 文件详解 文件名称: phylogenetic_tree_files.zip 文件格式: ZIP压缩包(.zip) 内容说明:...
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  • Nudix超家族功能进化数据集

    2025年12月23日 30 101 17

    数据集概述 该数据集围绕Nudix超家族蛋白功能进化展开,整合了205个Nudix蛋白的实验与结构数据,修正并补充了基因本体注释,构建了序列比对与系统发育树,分析了水解酶基序下游环区的结构功能关系,揭示功能辐射的结构基础及系统发育规律。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件,具体说明如下: - 代码文件: - 3DCOMB_alignment.py:...
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  • RefPlantNLR实验验证植物NLR数据集及脚本20200528_415

    2025年12月23日 30 207 199

    数据集概述 该数据集是RefPlantNLR的补充资料,包含经实验验证的植物NLR(核苷酸结合寡聚化结构域样受体)相关序列、注释及分析结果,涵盖氨基酸序列、CDS序列、基因组序列、结构域注释、系统发育树等多类型数据,为植物免疫研究提供基础数据支持。 文件详解 该数据集包含补充表格和数据集文件,具体说明如下: - 补充表格文件: -...
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  • 个体差异掩盖两种鹡鸰姐妹种鸣声地理变异数据集2025

    2025年12月22日 30 170 19

    数据集概述 本数据集包含伯特氏鹡鸰和草原鹡鸰两种姐妹种的鸣声与地理相关数据,涵盖鸣声特征、地理距离、多维尺度分析结果等,用于研究个体差异对鸣声地理变异的影响,支持鸟类声学与行为生态学研究。 文件详解 基础信息文件: Supplementary Table...
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  • 辅助NLR通道细胞器钙触发植物免疫补充数据集

    2025年12月20日 30 69 6

    数据集概述 本数据集为《辅助NLR通道细胞器钙触发植物免疫》手稿的补充数据,包含13个文件,涵盖氨基酸序列、钙传感器强度原始数据、系统发育树等内容,支持植物免疫机制相关研究。 文件详解 氨基酸序列与比对文件: Data_S1.zip(压缩包):NbNRG1与AtNRG1的氨基酸比对数据 Data_S6.fasta(FASTA):用于系统发育分析的NB-...
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  • 巽他_萨赫尔植物区系交换与西南太平洋扩散路径数据集

    2025年12月19日 30 63 44

    数据集概述 本数据集围绕巽他-萨赫尔植物区系交换及湿热带森林树木向西南太平洋的扩散路径展开,通过系统发育与生物地理分析,揭示Dysoxylum s.l.属植物的起源、演化及扩散机制,识别西南太平洋的主要扩散路径。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件,具体说明如下: - 文档与说明文件: - README.md:...
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  • 豆科植物古多倍体系统发育基因组与白垩纪_古近纪灭绝事件关联数据集

    2025年12月15日 30 74 2

    数据集概述 本数据集围绕豆科植物起源与早期演化展开,聚焦其古多倍体事件与白垩纪-古近纪(K-Pg)大灭绝事件的关联。通过基因树 reconciliation、基因计数数据及系统发育超网络重建等方法,结合36个核基因的时钟模型与20个化石校准点,分析豆科植物全基因组复制(WGD)事件的时间线,为理解新生代生物多样性起源提供数据支持。 文件详解...
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  • 节肢动物化学感觉相关基因家族进化历史数据集

    2025年12月15日 30 32 7

    数据集概述 本数据集围绕节肢动物门化学感觉相关基因(CRG)家族的进化历史展开,包含多类支持文件。通过整合新节肢动物基因组、转录组及桡足类(如近亲真宽水蚤)的基因组数据,分析CRG家族的起源、扩张与丢失,为理解节肢动物化学感觉系统的演化提供基础数据。 文件详解 补充材料文档:...
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  • 真菌NUDIX酶多样性分析数据集

    2025年12月14日 30 111 61

    数据集概述 本数据集涵盖真菌NUDIX酶多样性分析的原始数据,包含补充文件(如真菌组装列表、蛋白ID、基序保守性等)和多个文件夹(分子对接结果、结构文件、序列比对、系统发育树),为研究真菌NUDIX酶的多样性与功能提供支持。 文件详解 补充文件: Supplementary_File_S1.xlsx:...
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  • 自消化鬼伞属蘑菇防御机制演化与爆发式多样化数据集

    2025年12月13日 30 104 35

    数据集概述 本数据集聚焦自消化鬼伞属(Coprinellus)蘑菇,围绕其防御机制演化与爆发式物种多样化的关联展开。包含支撑相关研究的文献补充材料、系统发育分析脚本及数据处理文件,为探究真菌适应性辐射及防御结构对演化的影响提供数据支持。 文件详解 补充信息文档: Supplementary Information...
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  • NCLDV核心基因蛋白比对与系统发育树附加数据集

    2025年12月10日 30 55 19

    数据集概述 本数据集包含NCLDV(核质大DNA病毒)家族核心基因的蛋白比对数据和系统发育树数据,以压缩包形式存储,为病毒基因进化与分类研究提供基础数据支持。 文件详解 文件名称: Additional data.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容说明: 压缩包内包含以下类型文件 蛋白比对文件: 采用FASTA格式存储 系统发育树文件:...
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  • 真菌星球2023年6月_马氏座壳孢数据集

    2025年12月9日 30 23 5

    数据集概述 该数据集围绕2023年6月真菌星球(Fungal Planet)发布的马氏座壳孢(Aschersonia mackerrasiae)展开,包含该真菌的系统发育分析相关数据,为研究其分类地位和演化关系提供支持。 文件详解 文件名称:Aschersonia mackerrasiae...
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  • GPCR功能特化进化引导残基分析数据集

    2025年12月5日 30 33 11

    数据集概述 本数据集包含用于研究GPCR功能特化的自动化直系同源识别流程生成的原始及中间文件,覆盖837个人类GPCR及3个额外受体,含BLAST+输出、多序列比对、系统发育树等关键分析文件。 文件详解 文件名称: GPCR_Ortholog_Identification_Files.zip 文件格式: ZIP压缩包 包含内容:...
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  • 小蜂总科转录组序列系统发育分析补充数据集

    2025年11月28日 30 87 22

    数据集概述 本数据集为小蜂总科(膜翅目:小蜂总科)转录组序列系统发育研究的补充数据,包含单基因比对、串联超级矩阵、分区文件及系统发育树等文件,支持探究其快速辐射、趋同演化及进化成功的历史。 文件详解 该数据集包含3个压缩文件,对应不同类型的系统发育分析数据: -...
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  • 膜翅目进化历史补充数据集

    2025年11月28日 30 42 1

    数据集概述 本数据集为《膜翅目进化历史》论文的补充数据,包含基因序列比对、系统发育分析数据集、决定性数据集、四簇似然映射分析数据及系统发育树结果等,支持膜翅目系统发育关系与进化历史的研究。 文件详解 1-Gene-MSAs_after-pal2nal文件夹:氨基酸(aa)和核苷酸(nt)序列的同源基因多序列比对文件,为序列比对优化后的数据。...
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