数据集概述
该数据集基于质体matK基因序列的综合系统发育分析，提出豆科植物新亚科分类方案，解决传统云实亚科非单系性问题，识别六个单系亚科。包含近完整属级取样（698属）及约20%物种（3696种）的序列数据，提供系统发育树及相关文件。
文件详解
- 系统发育树文件（.tre格式，共5个）：
- C_LPWG_matK2016_bootstrap_majority-rule_consensus_tree_RAxML.tre：RAxML构建的带自举支持的多数规则一致树
- E_LPWG_matK2016_1000_posterior_trees_Phylobayes.tre：Phylobayes生成的1000棵后验树
- B_LPWG_matK2016_Bayesian_majority-rule_consensus_tree_Phylobayes.tre：Phylobayes构建的贝叶斯多数规则一致树
- D_LPWG_matK2016_best-scoring_maximum_likelihood_tree_RAxML.tre：RAxML最优最大似然树
- F_LPWG_matK2016_1000_bootstrap_trees_RAxML.tre：RAxML生成的1000棵自举树
- 文档文件（.pdf格式，共3个）：
- Poster_LPWG_HD_final_v2.pdf：高清海报文件
- Poster_LPWG_LD_final_v2.pdf：低清海报文件
- Fig.Supp.RAXML.pdf：补充图表文件
- 凭证信息文件：
- TableS1_LPWG_matK2016_vouchers.xls：Excel格式，包含序列凭证信息
- 比对矩阵文件：
- A_LPWG_matK2016_aligned_matrix.nex：Nexus格式，matK基因序列比对矩阵
适用场景
- 豆科植物分类学研究：验证或更新豆科亚科分类系统
- 系统发育分析：用于豆科植物进化关系相关研究的基础树结构
- 生物多样性研究：支撑豆科植物物种多样性分布与演化分析
- 植物分子系统学教学：作为matK基因序列分析及系统发育树解读的案例数据
