数据集概述
本数据集包含91个果蝇遗传参考面板(DGRP)品系的卵滞留与受精成功相关数据,通过显微观测方法获取表型变异,并结合全基因组关联分析探究遗传基础。数据涵盖品系均值、计数方法说明及原始计数结果,可用于研究果蝇繁殖性状的遗传机制及卵胎生进化路径。
文件详解
- 文档文件(Document files)
- 文件名称:README_for_Line_means.txt、README_for_Fiji_counting.txt、README_for_Egg_retention_counts.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:分别说明品系均值计算方法、Fiji计数工具使用规范、卵滞留计数数据的采集标准与字段定义
- 数据文件(Data files)
- 文件名称:Line_means.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含RAL(DGRP品系ID)、N(重复测量次数)、sum(总胚胎计数)、retention_mean±se(卵滞留均值±标准误)、unfertilized_ratio_mean±se(未受精率均值±标准误)字段
- 文件名称:Egg_retention_counts.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含RAL(品系ID)、repl(重复次数)、unfertilized(未受精卵数)、cell_blast(细胞囊胚期胚胎数)、gastrul(原肠胚期胚胎数)等各发育阶段胚胎计数及sum(总计数)、sum-unf(受精卵总数)、UNFERT(未受精率)字段
- 归档文件(Archive files)
- 文件名称:Fiji_counting.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含Fiji图像分析软件的计数工具配置文件与使用说明
数据来源
论文“The genetics of egg retention and fertilization success in Drosophila: one step closer to understanding the transition from facultative to obligate viviparity”
适用场景
- 果蝇繁殖性状遗传机制研究: 通过GWAS数据与表型关联分析,识别调控卵滞留与受精成功的关键基因
- 卵胎生进化路径分析: 基于繁殖性状变异数据,探究兼性卵胎生向专性卵胎生过渡的潜在进化机制
- 遗传参考面板品系特征分析: 利用DGRP品系的表型数据,构建繁殖性状的遗传变异图谱
- 发育生物学研究: 通过不同胚胎发育阶段的计数数据,分析卵滞留对胚胎发育进程的影响
- 行为遗传学研究: 结合嗅觉行为、交配行为相关基因数据,探究繁殖后生理过程的调控网络