数据集概述
本数据集为论文配套数据,记录长期严重缺氧适应诱导的非经典上皮间质转化(EMT)及新型WT1转录因子亚型(tWt1)相关研究数据,包含RNA测序、ChIP测序、质谱等多组学数据,共5个文件,用于支持缺氧微环境对肿瘤细胞影响及新型WT1亚型功能的研究。
文件详解
- README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含数据来源、对应论文链接及各文件内容概述
- MS_data_table.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:质谱分析数据表,记录与缺氧适应及WT1亚型相关的蛋白表达或修饰数据(具体字段未完全展示)
- tWT1-GFP_ChIPseq.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:tWt1-GFP的ChIP-seq数据分析结果,包含PeakID、基因注释等ChIP测序相关字段
- miRs_0.1vs5.complete.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:不同氧浓度(0.1% vs 5%)处理下的miRNA差异表达数据,包含miRNA ID、各样本表达量及标准化表达量等字段
- DEGs_0.1vs5.complete.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:不同氧浓度(0.1% vs 5%)处理下的差异表达基因(DEGs)数据,包含基因ID、各样本表达量及标准化表达量等字段
数据来源
Dryad数据平台(DOI: 10.5061/dryad.cz8w9gjb4)
适用场景
- 肿瘤缺氧微环境研究:分析长期严重缺氧对肿瘤细胞EMT转化的影响机制
- 转录因子亚型功能分析:探究新型WT1亚型(tWt1)的DNA结合特性及在肿瘤中的作用
- 多组学数据整合分析:整合RNA测序、ChIP测序、质谱数据,解析缺氧诱导的分子调控网络
- 肿瘤预后标志物研究:验证tWt1与卵巢癌患者长期生存的相关性,评估其作为预后标志物的潜力