数据集概述
本数据集围绕墨西哥中部淡水鱼类宿主（Goodeinae）及其吸虫寄生虫（Margotrema spp.）的历史生物地理学与协同进化关系展开，包含分子标记序列、系统发育树、生物地理学模型等分析文件，用于探究宿主与寄生虫的共同演化模式及影响因素。
文件详解
- 分子序列与系统发育文件
- 文件名称：DRYAD_1_MartinezAquino_et_al_PLOS1_COI_ITS_alignment.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：包含线粒体COI和核ITS1分子标记的序列比对数据，用于构建寄生虫的物种树。
- 系统发育树文件
- 文件名称：DRYAD_8_MartinezAquino_et_al_PLOS1_TreeMap.tgl.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：宿主与寄生虫的系统发育树数据，用于协同进化分析。
- 生物地理学模型代码文件（共5个）
- 文件名称：DRYAD_7_MartinezAquino_et_al_PLOS1_lagrange_Margo_host2.lagrange.py、DRYAD_6_MartinezAquino_et_al_PLOS1_lagrange_Margo_host.lagrange.py、DRYAD_5_MartinezAquino_et_al_PLOS1_lagrange_Margo_loc_3.lagrange.py、DRYAD_4_MartinezAquino_et_al_PLOS1_lagrange_Margo_loc_2.lagrange.py、DRYAD_3_MartinezAquino_et_al_PLOS1_lagrange_Margo_loc.lagrange.py
- 文件格式：PY
- 字段映射介绍：基于DEC模型的历史生物地理学分析代码，用于模拟寄生虫的地理扩散、灭绝与分支事件。
- 系统发育分析配置文件
- 文件名称：DRYAD_2_Martinez_Aquino_et_al_PLOS_starBEAST_YP_n_u.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：starBEAST软件的配置文件，用于构建寄生虫的物种树并进行分子定年分析。
数据来源
论文“Do the historical biogeography and evolutionary history of the digenean Margotrema spp. across central Mexico mirror those of their freshwater fish hosts (Goodeinae)?”
适用场景
- 宿主-寄生虫协同进化研究: 分析Margotrema spp.与Goodeinae鱼类的共同演化模式，包括共 speciation、宿主转换等事件。
- 历史生物地理学分析: 探究墨西哥中部地质历史（如更新世）对寄生虫地理分布与分化的影响。
- 分子系统发育构建: 利用COI和ITS1序列数据构建寄生虫的物种树，推断其演化关系。
- 生物地理学模型验证: 应用DEC模型模拟寄生虫的扩散、灭绝与分支过程，验证地理因素对演化的作用。
- 宿主特异性研究: 分析寄生虫在物种、谱系、部落水平上与宿主的特异性关联模式。
