找到16个数据集

标签: 物种树构建

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  • Dryad_Source_猫科动物基因组系统发育与杂交研究数据

    2026年1月28日 30 44 26

    数据集概述 本数据集是支持猫科动物基因组古代杂交研究的SNP矩阵数据,基于全基因组SNP芯片基因型与线粒体基因组等数据整合,用于分析猫科动物基因组中的系统发育差异及杂交信号,揭示现代猫科动物基因组的嵌合起源及性染色体在物种形成后基因流中的作用。 文件详解 文件名称:Felidae_SNPmatrix_Dryad.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • UCE_Based_超保守元件目标捕获与测序比较研究数据

    2026年1月30日 30 144 63

    数据集概述 本数据集为超保守元件(UCEs)目标捕获与大规模平行测序研究相关数据,包含五种新热带雨林鸟类的UCE基因座数据,涉及物种树构建、溯祖模型分析及物种界定等研究内容,共8个文件,支持浅进化时间尺度下的遗传比较分析。 文件详解 压缩文件(archive_files)...
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  • UCE_Based_新热带界雨林鸟类超保守元件基因测序研究数据

    2026年1月29日 30 90 70

    数据集概述 本数据集为浅进化时间尺度比较研究的超保守元件(UCEs)目标捕获与大规模平行测序数据,包含5种新热带界雨林鸟类的776-1516个UCE位点,53-77%位点具多态性,平均每个多态位点含2.0-3.2个可变位点,可用于物种树构建、溯祖建模及物种界定等分析。 文件详解 主数据压缩包 文件名称:full.zip 文件格式:ZIP...
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  • Mabuyine_Based_非洲石龙子极端母体营养进化研究数据

    2026年1月28日 30 207 75

    数据集概述 本数据集为非洲 Mabuyine 石龙子极端母体营养进化研究的相关数据,基于多基因座 DNA 数据构建物种树,探讨极端母体营养在非洲 Mabuyine 石龙子中的进化起源,支持相关生物进化分析,仅包含一个文件。 文件详解 文件名称:sBEAST_11genes_2mtrates.xml 文件格式:XML...
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  • RevBayes_Based_多态感知物种树与进化力估计补充数据

    2026年1月28日 30 200 101

    数据集概述 本数据集为论文《Polymorphism-aware estimation of species trees and evolutionary forces from genomic sequences with...
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  • 弗林索玛_Phrynosoma_物种的参考分类学_生物多样性及系统发育评估

    2026年1月21日 30 38 24

    数据集概述 本数据集为角蜥属(Phrynosoma)物种的系统基因组生物多样性评估数据,包含ddRADseq和线粒体DNA等分子数据文件,用于构建参考分类框架,解决大短角蜥物种复合体的物种界定争议,支持物种树构建、分歧时间估算及种群遗传分析,共9个相关文件。 文件详解 文件名称:README.txt 文件格式:TXT...
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  • Saltugilia_Comparative_花大小进化发育比较转录组分析数据

    2026年1月19日 30 188 186

    数据集概述 本数据集为Saltugilia属(花荵科)花大小进化发育的比较转录组分析数据,包含转录组从头组装、质体与核基因序列比对及注释报告,用于探究花大小进化的遗传基础,支持植物花形态与传粉者协同进化的研究。 文件详解 denovo_assemblies.tar 文件格式:TAR...
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  • snakes_phylogenomics_Based_蛇类科间系统发育基因组关系研究数据

    2026年1月13日 30 147 71

    数据集概述 本数据集为蛇类科间系统发育关系研究的基因组数据,包含3776个核基因座的超保守元件序列,涉及29种蛇类(覆盖几乎所有科),是此前研究数据量的约100倍。数据用于解析蛇类主要类群间的亲缘关系,揭示了3个新分支,为脊椎动物系统发育研究提供支撑。 文件详解 序列文件(.phy格式)...
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  • Ambystoma_tigrinum_Based_北美虎纹钝口螈物种复合体种群遗传与系统发育分析数据

    2026年1月4日 30 127 84

    数据集概述 本数据集为北美虎纹钝口螈物种复合体的种群遗传与系统发育研究数据,通过平行标记扩增子测序技术对95个核基因座、93个个体的样本进行分析,包含生物信息学处理后的基因型、单倍型序列等结果,可用于遗传聚类、物种树构建等研究,共含5个文件。 文件详解 Structure Files.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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  • DRYAD_Based_墨西哥淡水鱼类宿主与寄生虫Margotrema_spp_协同进化研究数据

    2026年1月8日 30 43 20

    数据集概述 本数据集围绕墨西哥中部淡水鱼类宿主(Goodeinae)及其吸虫寄生虫(Margotrema spp.)的历史生物地理学与协同进化关系展开,包含分子标记序列、系统发育树、生物地理学模型等分析文件,用于探究宿主与寄生虫的共同演化模式及影响因素。 文件详解 分子序列与系统发育文件...
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  • Anchored_Phylogenomics_Source_马达加斯加伪蝰蛇系统发育比较研究数据集

    2026年1月6日 30 137 56

    数据集概述 本数据集为马达加斯加伪蝰蛇(Pseudoxyrhophiinae)系统发育研究的原始数据,包含基于5个Sanger测序基因位点和377个锚定基因组位点的两种分子数据集,用于比较不同测序规模和分析方法对物种树构建的影响,为蛇类系统进化研究提供基础数据。 文件详解 文件名称:AHE_Snake_ProbeDesign.zip 文件格式:ZIP...
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  • 坦噶尼喀湖慈鲷鱼类物种树估计与基因渗入分析数据集

    2025年12月20日 30 97 91

    数据集概述 本数据集聚焦东非坦噶尼喀湖慈鲷鱼类,包含45个物种共522个个体的多标记基因数据,通过新方法分析快速分化谱系中的基因渗入现象,构建稳健物种树,支持进化生物学中适应性辐射相关研究。 文件详解 文件名称:Meyer_et_al_supplementary_information.pdf 文件格式:PDF...
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  • 伪熊蜂基因树估计误差与超保守元件实证研究数据集

    2025年12月14日 30 86 57

    数据集概述 本数据集围绕伪熊蜂属(Pseudapis)的基因树估计误差展开实证研究,对比PhyloBayes、MrBayes、IQ-Tree和RAxML四种方法在超保守元件(>800个)分析中的表现,评估其对物种树构建的影响,为基因树估计提供实践指导。 文件详解 文件名称: readme.txt,格式: TXT,内容:...
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  • 鸟类辐射进化基因组位点系统发育研究数据集

    2025年12月12日 30 71 43

    数据集概述 本数据集围绕雀形目柳莺属8种鸟类的基因组系统发育研究展开,包含基因流对系统发育重建影响的分析数据,涵盖模拟输入、重组率估计、系统发育网络等多类型文件,为探究基因组数据与物种真实进化关系的差异提供支持。 文件详解 群体遗传学模拟输入文件:...
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  • 异常区附近串联法失效研究数据集

    2025年12月10日 30 121 61

    数据集概述 本数据集围绕基因组测序中串联法在物种树构建的失效问题展开,聚焦异常区(因不完全谱系分选导致最常见基因树与物种树不匹配的参数空间)内外,分析似然法与简约法在串联数据上的性能差异,为改进物种树恢复方法提供理论与实验依据。 文件详解 说明文档(.txt格式):...
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  • 金虎尾目物种树异质性影响因素研究数据集

    2025年12月6日 30 70 60

    数据集概述 本数据集聚焦被子植物金虎尾目(Malpighiales)物种树构建问题,包含423个单拷贝基因座数据及相关分析结果,探究基因树估计误差、不完全谱系分选和基因流对该类群系统发育分辨率的影响,为理解快速辐射类群的进化机制提供数据支持。 文件详解 文件名称:Supplementary_Materials.pdf 文件格式:PDF...
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