数据集概述
本数据集围绕Amaranthus属展开,包含94份基因库材料(覆盖35个物种)的GBS测序数据及基因组大小测量结果,用于分析该属系统发育关系与基因组大小进化规律,为解决其分类学争议、揭示栽培物种起源提供数据支持。
文件详解
- 文件名称:dryad.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含支撑Amaranthus属系统发育分析的核心数据,推测涵盖GBS测序的SNP数据(de novo与参考基因组比对两种方法的结果)、系统发育树构建文件、94份材料的基因组大小测量值等,具体字段需解压后查看原始数据结构。
数据来源
Dryad数据库(对应论文“Analysis of phylogenetic relationships and genome size evolution of the Amaranthus genus using GBS indicates the ancestors of an ancient crop”)
适用场景
- 植物系统发育研究:基于SNP数据构建系统发育树,验证Amaranthus属亚属分类及种间亲缘关系。
- 作物起源进化分析:探究Amaranthus属栽培物种(如籽粒苋)的野生祖先及驯化路径。
- 基因组大小进化研究:分析该属基因组大小变异规律,探讨多倍化事件对进化的影响。
- 植物遗传资源评估:为Amaranthus属基因库材料的分类与利用提供遗传背景数据。