数据集概述
本数据集为论文配套的数据，基于斐济灌木莺（Horornis ruficapilla）的基因组数据，研究岛屿大小和距离对基因流的影响，验证岛屿生物地理学理论在基因组层面的适用性。包含基因序列、变异数据、分析配置及结果表格等8个文件，支持相关假设检验与后续研究。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称：README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：描述Dryad上传文件的说明文档，对应论文“A test of island biogeographic theory applied to estimates of gene flow in a Fijian bird is largely consistent with neutral expectations”
- 文件名称：horornis_partitions.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：DNA序列分区信息，包含Subset1至Subset8共8个分区，记录每个分区的碱基位置范围（如Subset1=1-1083）
- 数据文件
- 文件名称：horornis_min95_renamed.phylip
- 文件格式：PHYLIP
- 字段映射介绍：斐济灌木莺的基因序列数据文件，采用PHYLIP格式存储
- 文件名称：horo_100_rand_noSingle.vcf、horo_100_rand.vcf
- 文件格式：VCF
- 字段映射介绍：基因变异数据文件，记录斐济灌木莺的单核苷酸多态性（SNP）信息
- 配置文件
- 文件名称：horornis_partition_finder.cfg
- 文件格式：CFG
- 字段映射介绍：PartitionFinder软件的配置文件，用于基因序列分区分析
- 结果表格文件
- 文件名称：TableS3_FullFastsimcoalFull.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含所有Kadavu个体的fastsimcoal完整输出结果补充表格
- 文件名称：TableS4_FullFastsimcoalNoAdmix.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：去除假定混合Kadavu个体后的fastsimcoal输出结果补充表格
数据来源
论文“A test of island biogeographic theory applied to estimates of gene flow in a Fijian bird is largely consistent with neutral expectations”配套的Dryad上传数据
适用场景
- 岛屿生物地理学理论验证: 利用基因流数据检验岛屿大小、距离对种群基因交流的影响，验证经典理论的基因组层面适用性
- 鸟类种群遗传学研究: 分析斐济灌木莺的种群结构、基因变异与分化模式
- 生物信息学方法应用: 基于UCEs序列、VCF变异数据开展种群 demographic 分析方法实践
- 进化生物学假设检验: 探究岛屿环境下物种形成与基因流的关系，为群岛物种进化研究提供框架
- 保护生物学研究: 为斐济灌木莺等岛屿鸟类的种群保护提供遗传学数据支持
