数据集概述
本数据集来自对极度濒危的Attwater草原鸡的研究，探讨免疫基因特定等位基因而非全基因组杂合性与免疫反应及生存的关系。包含9个文件，涵盖免疫基因分析数据、生存分析输入数据、基因序列文件及分析说明文档，支持对濒危物种免疫适应性和生存机制的研究。
文件详解
- 数据文件（.xlsx/.csv/.fna）
- 文件名称：MHC_I_counts_per_indiv.xlsx、MHC_II_counts_per_indiv.xlsx、Barcode key for raw 454 reads.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射：包含个体MHC I/II等位基因计数、454测序原始数据条形码对应关系等信息
- 文件名称：APCcoxme_input.csv、APC_immune_response_for_Dryad.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射：包含个体编号、家族ID、性别、年龄、体重、全基因组杂合度（20990 SNPs）、TLR/MHC等免疫基因等位基因数据、免疫反应指标（溶菌酶值、凝集反应等）及生存天数等字段
- 文件名称：Johnson_2787X.fna、Johnson_2821X.fna
- 文件格式：FNA
- 字段映射：免疫基因相关的核苷酸序列文件
- 说明文档（.txt）
- 文件名称：READ ME for immune response analyses.txt、R code for APC survival analyses.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射：免疫反应分析说明文档、生存分析R代码脚本
数据来源
Dryad数据平台（来源研究：Specific alleles at immune genes, rather than genome-wide heterozygosity, are related to immunity and survival in the critically endangered Attwater's prairie-chicken）
适用场景
- 濒危物种保护研究：分析免疫基因多样性对Attwater草原鸡生存的影响，为保护策略制定提供依据
- 免疫生态学研究：探讨TLR/MHC等免疫基因与个体免疫反应的相关性
- 进化生物学研究：比较免疫基因特定等位基因与全基因组杂合性对生存适应性的作用机制
- 保护遗传学研究：利用免疫基因数据评估濒危种群的遗传健康状况
