数据集概述
本数据集围绕二肽和三肽通透酶A（DtpA）的转运循环构象景观展开，包含模拟运行所需的输入、结构、参数文件，分析脚本及亚稳态模型文件，共七个文件，支持对DtpA转运机制的分子动力学模拟与构象分析。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称：Readme_zenodo.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含数据背景、文件内容及使用指引等信息
- 压缩包文件
- 文件名称：4OUTOCC.zip、2INWOCC.zip、1INWOPN.zip、3OCC.zip、5OUTOPN.zip、SIMULATION_FILES.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含DtpA转运循环不同构象状态（如结合、开放、转运等状态）的模拟输入文件、结构文件（PSF/PDB）、参数文件及分析脚本等
适用场景
- 蛋白质转运机制研究：分析DtpA在转运循环中的构象变化规律，揭示其底物转运的分子机制
- 分子动力学模拟复现：利用SIMULATION_FILES.zip等文件复现DtpA转运循环的分子动力学模拟实验
- 蛋白质构象景观分析：通过亚稳态模型文件研究DtpA转运过程中的构象转变路径与能量变化
- 生物信息学教学实践：作为蛋白质结构与功能研究的案例数据，支持分子动力学模拟相关教学与实践
