数据集 - 海数据

CommunChem_Petermeier_Based生物基苯乙烯衍生物化学酶法合成工艺优化数据2024

2025年12月31日 30 85 56

数据集概述本数据集为生物基苯乙烯衍生物化学酶法合成研究的支持数据，聚焦水活度的连续控制对反应效率的影响。包含实验数据、分子动力学模拟配置、力场文件及核磁共振数据，用于分析底物高负载下酶活性维持机制，实现两步级联合成工艺强化，支撑高效、低废的 lignin 衍生原料增值研究。文件详解 2024_CommunChem_Petermeier_MD-...

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GROMACS_CHARMM36m_Aβ肽与Cu_II_复合物水_二氯乙烷界面分子动力学模拟数据

2026年1月9日 30 124 88

数据集概述本数据集包含三种系统的分子动力学模拟输入、参数及轨迹文件：Aβ₁₋₁₆在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）、Aβ₄₋₁₆在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）、Aβ₄₋₁₆–Cu(II)复合物在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）。模拟基于GROMACS 2020.6与CHARMM36m力场，含TB⁻、BA+等有机离子参数，pH...

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Virtual_screening_Based_牛奶蛋白甜肽虚拟筛选及分子动力学模拟机制分析数据

2026年1月9日 30 133 36

数据集概述本数据集围绕牛奶蛋白甜肽的虚拟筛选及分子动力学模拟机制分析展开，包含5个Excel文件，涉及甜肽预测结果、牛奶蛋白虚拟水解序列、苦味预测结果及ADMET相关数据，为蛋白质组学中甜肽的筛选与机制研究提供数据支持。文件详解文件名称：ADMET.xlsx 文件格式：XLSX...

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MD_dynamics_data_Based_Oxyluciferin发光物种结构分析数据_压缩包

2026年1月7日 30 197 70

数据集概述本数据集聚焦于Oxyluciferin发光物种在水溶液和荧光素酶介质中的结构分析，包含1个压缩文件，未划分训练/测试集、数据/标签集或原始/处理数据集，无自述文件或内容预览，可用于相关分子结构研究。文件详解压缩文件文件名称：MD_dynamics_data.zip 文件格式：ZIP...

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Enhancing_ReaxFF_DFT_Based_LiF力场重参数化数据库_V1_0_0_beta

2026年1月2日 30 99 26

数据集概述本数据集为LiF无机化合物ReaxFF力场重参数化所用的DFT数据库，旨在提升LiF体系ReaxFF计算的准确性与可靠性。数据库包含LiF相关DFT模拟数据及元数据，支持通过ASE命令行、网页界面及Python接口进行交互，可用于锂离子电池分子动力学模拟的力场优化研究。文件详解...

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Nature_Communications_Source_Data_羟基甲烷磺酸盐界面加速效应研究数据

2026年1月2日 30 66 40

数据集概述本数据集是Nature Communications论文“Hydroxymethanesulfonate Formation accelerated at the Air-water Interface by Synergistic Enthalpy-Entropy...

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MD_Snapshots_Based_ɑ_hairpinin支架工程构建钾离子通道阻滞剂分子动力学模拟数据

2025年12月30日 30 176 62

数据集概述本数据集包含25组Kv1.3通道与Tk-hefu肽类似物复合物的分子动力学（MD）模拟快照，记录模拟初始（0ns）和结束（110ns）状态，同时附带2份通道与肽间分子间相互作用分析的Excel表格，为钾离子通道阻滞剂研究提供结构动态数据支持。文件详解压缩文件（Kv1.3_Tk-hefu-deriv_complexes.zip）...

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基于AlphaFold2的SARS_CoV_2奥密克戎刺突蛋白与ACE2受体构象及结合机制分析结果_压缩文件

2025年12月29日 30 84 8

数据集概述本数据集围绕SARS-CoV-2刺突蛋白Omicron变体与ACE2受体的复合物展开，通过AlphaFold2构建的结构集合及分子动力学模拟，探索其构象景观与结合机制，为病毒-受体相互作用的研究提供支撑。文件详解压缩文件文件名称：SpikeProteinsResultsUpdated.zip 文件格式：ZIP...

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Molecular_Dynamic_Simulation_Based_CL5D加速SIRT6产物解离研究数据

2025年12月29日 30 19 9

数据集概述本数据集包含CL5D加速SIRT6产物解离的分子动力学模拟相关数据，涵盖SIRT6及SIRT6-CL5D系统的初始结构、平衡结构快照、模拟配置文件及图表源数据，支持论文图表生成与模拟过程复现，总计包含14个文件。文件详解源数据文件文件名称：Source Data.xlsx 文件格式：XLSX 字段映射介绍：用于生成论文正文图表的源数据...

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Unveiling_Light_Harvesting_Proteins_光捕获蛋白远程作用力研究数据2024

2025年12月29日 30 141 90

数据集概述本数据集对应论文“Unveiling Long-Range Forces in Light Harvesting Proteins: Pivotal Roles of Temperature and Light”，包含研究光捕获蛋白中远程作用力的数据，涉及温度和光的影响。数据集共3个文件，主要支持论文相关实验结果的展示与验证。文件详解...

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grsq_Based_分子动力学模拟X射线散射有限尺寸效应消除计算数据_final_resubmission

2025年12月29日 30 81 45

数据集概述本数据集是同名研究工作的数据仓库，用于消除分子动力学模拟中X射线散射计算的有限尺寸效应。提供与JCP期刊最终重提交版本配套的文件，包含可生成论文图表的代码和示例数据压缩包，共一个文件。文件详解文件名称：grsq_examples-final_resubmission.zip 文件格式：ZIP...

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脂质驱动的HCV_p7二聚体模拟_坐标与拓扑文件

2025年12月18日 30 11 7

数据集概述本数据集包含脂质驱动的HCV p7二聚体模拟相关的坐标与拓扑文件，以压缩包形式存储，为研究HCV p7蛋白结构及脂质环境下的模拟过程提供数据支持。文件详解文件名称: p7_dimer_systems.zip 文件格式: ZIP压缩包 (.zip) 内容说明: 压缩包内包含脂质驱动的HCV...

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约束测试文件数据集

2025年12月9日 30 87 24

数据集概述本数据集包含约束回归测试相关的文件，主要由行业基准系统和T4溶菌酶轨迹两部分组成，为约束测试的验证与分析提供数据支持。文件详解该数据集包含两个压缩文件，具体说明如下： - industry_benchmark_systems.zip:...

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Masoud_Mirzaei_Hossein_Fazli_Based_聚合物大分子相分离实验手稿完整数据

2025年12月23日 30 143 18

数据集概述本数据集为Masoud Mirzaei与Hossein Fazli提交的研究手稿提供图表支持，核心围绕强、单价、短程单体间相互作用对聚合物大分子相分离的影响展开，包含实验相关的原始数据与可视化结果文件。文件详解文本数据文件（.txt格式，10个）：如msd-2-kappa2-lambda0.8-A.txt、dens-...

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副本交换分子动力学模拟输入参数及构象数据集

2025年12月23日 30 26 4

数据集概述本数据集包含副本交换分子动力学（REMD）模拟的输入文件、参数文件以及310K温度下的初始和最终构象数据，为分子动力学模拟研究提供了基础数据支持。文件详解该数据集由41个ZIP格式的压缩文件组成，具体说明如下： - 压缩文件组：共41个，文件格式均为ZIP（.zip），包含模拟相关的输入、参数及构象数据。 -...

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FicD的TPR结构域功能动力学与ATP和BiP相互作用数据集

2025年12月23日 30 171 45

数据集概述本数据集包含FicD的TPR结构域功能动力学研究相关的分子动力学（MD）模拟数据，核心围绕其与ATP和BiP相互作用的调控机制，为蛋白质结构功能分析提供数据支持。文件详解文件名称: FicD-MD-Data.zip 文件格式: ZIP压缩包（.zip）文件内容:...

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甲烷球菌属苹果酸脱氢酶热适应与潜在变构关联数据集

2025年12月23日 30 28 20

数据集概述本数据集为研究论文《Unraveling the link between thermal adaptation and latent allostery in malate dehydrogenase from...

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通道视紫红质C1C2_ChR2和iChloC的孔道开放与离子传导机制模拟输入数据集

2025年12月23日 30 75 2

数据集概述本数据集包含用于分子动力学（MD）模拟的输入文件，围绕通道视紫红质C1C2、ChR2和iChloC的孔道开放与离子传导机制展开，提供模拟所需的初始配置及参数。文件详解文件名称：MDdata.zip 文件格式：ZIP压缩包（.zip）文件内容：包含分子动力学模拟运行所需的起始配置文件和全部必要参数文件适用场景...

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SARS_CoV_2主蛋白酶活性位点环构象空间研究数据集

2025年12月22日 30 46 7

数据集概述本数据集为研究论文配套数据，聚焦SARS-CoV-2主蛋白酶活性位点环的构象空间，包含分子动力学模拟数据、图表基础数据及补充视频，支持探究配体结合与原体间变构效应的作用机制。文件详解压缩包文件: mpro_data.zip: ZIP格式压缩包，包含两个子目录： md_data目录: 所有模拟系统的分子动力学（MD）数据，含初始和最终构象...