数据集概述
本数据集包含与杜鹃性别限制多态性进化及遗传结构研究相关的生物信息学代码和图表绘制输入数据，支持论文核心结果的复现，涵盖GWAS分析、群体遗传学统计、系统发育树及光谱数据等多维度研究内容。
文件详解
该数据集包含18个文件，按类型分类说明如下：
- 生物信息学代码文件：
- Merondun_Bioinformatic-Code.html：HTML格式的代码文档
- Merondun_Bioinformatic-Code.md：Markdown格式的代码文档
- 功能：提供基因分型分析的相关代码，支持研究方法复现
- 图表输入数据文件（.txt格式为主）：
- GWAS分析数据：如Fig1C_GWAS_lrt2pvalue2log.txt（包含chr、bp、lrt、pval、-log10pval等字段）、FigS3_GWAS_replicates_lrt2pvalue2log.txt
- 群体遗传学统计数据：如Fig_4C_Jackknife_Dstatistics.txt、Fig_4D__TajimasD.txt.gz
- 系统发育与群体结构数据：如Fig_3A__MLTreeInput.contree（系统发育树文件）、FigS2-NgsAdmix_Autos_Hungarian.txt（群体结构分析结果）
- 光谱数据：Fig2C_Raman_300-2500_AvgSpectra.txt（拉曼光谱平均数据）
- 其他统计分析数据：如Fig_3B__Qcoefficients.txt（Q系数数据）、FigS1-Rxy_Hungarian.txt（Rxy统计数据）
- 压缩与其他格式文件：
- 压缩文件：Fig_4E__Twisst_plotting.tar.gz、Fig_4D__TajimasD.txt.gz（压缩数据文件）
- 群体遗传结构分析文件：Fig_3D__Autosomes.IF-GF-MM2-BP-ANN-AC2.TransSpecies.eigenvec（特征向量文件）、Fig_3D__Autosomes.IF-GF-MM2-BP-ANN-AC2.TransSpecies.eigenval（特征值文件）
适用场景
- 群体遗传学研究：复现杜鹃性别限制多态性相关的GWAS分析、群体结构解析
- 进化生物学研究：分析杜鹃物种的系统发育关系、基因流模式及选择压力
- 生物信息学方法验证：验证基因分型分析流程及图表绘制方法的可行性
- 论文结果复现：支持《Evolution and genetic architecture of sex-limited polymorphism in cuckoos》一文核心图表的重现与扩展分析
