数据集概述
本数据集为红恶魔蜘蛛(Dysderidae科)系统发育研究的基因数据,包含线粒体(cox1、16s、12s)和核基因(h3、28s、18s)的多基因序列,以及串联序列、分化时间估算文件和补充信息表格,覆盖104种Dysderidae蜘蛛及83种相关科物种,用于构建系统发育框架并分析多样化速率。
文件详解
- 基因序列文件(.fasta格式,共7个)
- 文件名称:28s_ginsi.fasta、12s_ginsi.fasta、cox1.fasta、18s_ginsi.fasta、h3.fasta、16s_ginsi.fasta、Concatenated.fasta
- 字段映射介绍:分别存储28s、12s、cox1、18s、h3、16s单基因的多序列比对结果,以及所有基因串联后的序列数据
- 分化时间估算文件(.xml格式,共2个)
- 文件名称:Dating6p.xml、Dating6pOF.xml
- 内容说明:用于估算Dysderidae科物种分化时间的校准文件
- 补充信息表格(.xlsx格式,1个)
- 文件名称:Supplemental_information_TableS1_&_TableS11.xlsx
- 内容说明:包含研究的补充表格数据
- 串联序列文件(.nex格式,1个)
- 文件名称:Concatenated_gapsAP.nex
- 内容说明:带间隙处理的串联基因序列数据
数据来源
论文“A targeted gene phylogenetic framework to investigate diversification in the highly diverse yet geographically restricted red devil spiders (Araneae, Dysderidae)”
适用场景
- 蜘蛛系统发育研究:构建Dysderidae科及相关类群的系统发育关系
- 生物多样性分析:分析Dysderidae科物种的多样化速率及驱动因素
- 进化生物学研究:探究Dysderidae科的起源时间、洞穴殖民历史等进化事件
- 分类学修订:基于系统发育结果完善Dysderidae科的亚科及属级分类体系
- 分子进化分析:研究线粒体与核基因在蜘蛛进化中的分子特征