EAW_16S_rRNA基因生物信息学课程FASTQ文件2018

数据集概述

本数据集包含二零一八年九月在意大利加尔达湖不同区域及深度采集的六个样本的十六S核糖体RNA基因测序数据,采用Illumina MiSeq技术生成,含正向(R1)和反向(R2)测序文件及相关描述文档,适用于生物信息学课程教学与实践。

文件详解

该数据集包含十四份文件,具体说明如下: - 描述文档: - EAW_2018_FASTQ_16S_description.pdf: PDF格式文档,提供样本采集、处理及测序的详细背景信息。 - 元数据文件: - EAW_2018_16S_metadata.ods: ODS格式表格,可能包含样本的元数据信息。 - 测序数据文件(GZIP压缩FASTQ格式): - 共十二份.gz文件,包含六个样本的双向测序数据,如ECOALPSWATER-16S-B0918D4stv_S128_L001_R2_001.fastq.gz等。 - 命名规则: 文件名包含项目标识、样本编号、测序方向(R1/R2)等信息。

数据来源

Eco-AlpsWater项目(ASP569),由Interreg Alpine Space计划资助;测序由FEM设施测序平台完成

适用场景

  • 生物信息学教学: 作为课程实践数据,用于教授十六S rRNA基因序列分析流程(如使用DADA2进行降噪和OTU聚类)。
  • 微生物生态学研究: 分析加尔达湖不同环境样本中的微生物群落组成与多样性。
  • 测序数据分析方法验证: 测试和比较不同生物信息学工具在处理Illumina MiSeq双端测序数据中的性能。
  • 环境微生物监测: 研究淡水环境中微生物群落结构与环境因子的关联。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 118.3 MiB
最后更新 2025年12月6日
创建于 2025年12月6日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。