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标签: DADA2

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  • ATCC_Even_Mock_Based_微生物组分析参考序列数据

    2026年1月27日 30 91 30

    数据集概述 本数据集包含ATCC Even Mock Community的16S rRNA基因参考序列及相关辅助文件，旨在支持微生物组分析中的模拟群落（mock community）质控与偏差评估。数据涵盖适用于DADA2分析工具的参考序列文件、数据库文件、物种信息表及流程复现代码，共9个文件，可用于微生物组实验中阳性对照的物种分类注释与偏差验证。...
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  • nifDdada2_Based_固氮酶nifD基因数据库数据_v1_1_0

    2026年1月21日 30 194 27

    数据集概述 本数据集为基于Arbitrator 2023构建的nifD基因数据库（版本1.1.0），遵循nifH数据库的构建原则与方法，用于DADA2分析流程。包含基因序列、分类信息等多格式文件，支持微生物固氮相关研究，共6个文件。 文件详解 Readme.txt 文件格式：TXT 字段映射介绍：包含引用信息、数据库构建方法说明及参考文献...
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  • Microbiota_profile_Based_猪脐带血微生物群研究工作流数据

    2026年1月19日 30 93 56

    数据集概述 本数据集围绕猪脐带血微生物群研究工作流构建，包含从采样、DNA提取到生物信息学分析的相关数据，涉及13份脐带血样本和2份阴性对照样本的微生物群特征，同时记录了实验过程中的污染物考量，为研究猪脐带血微生物群提供结构化数据支持。 文件详解 Ps_umbilical.rds 文件格式：RDS...
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  • Metabarcoding_Based_河流eDNA样本DADA2处理ASVs表格数据

    2026年1月14日 30 104 16

    数据集概述 本数据集为河流环境DNA（eDNA）样本经DADA2去噪后的扩增子序列变体（ASVs）表格数据，包含三种分子标记（12S、18S、COI）的处理结果及元数据文档，共4个文件，用于河流生物多样性相关研究。 文件详解 数据文件（CSV格式，共3个）...
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  • RDP真菌LSU分类训练数据集_DADA2格式_第11版

    2025年12月23日 30 21 16

    数据集概述 该数据集是为DADA2工具格式化的RDP真菌LSU分类训练数据（第11版），基于RDP分类器原始训练集和真菌未对齐序列处理生成，包含多种压缩与未压缩格式的训练文件，用于微生物分类学分析。 文件详解 该数据集包含6个文件，具体说明如下： - 分类训练文件: - RDP_LSU_fixed_train_set_v2.fa:...
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  • 环境毒物对熊蜂健康及其微生物组的直接与间接影响数据集

    2025年12月14日 30 125 43

    数据集概述 本数据集围绕环境毒物对熊蜂健康及其微生物组的直接与间接影响展开研究，包含不同化学物质（如杀虫剂、重金属等）暴露下熊蜂生存数据及微生物组分析结果，为理解环境污染物对传粉昆虫的影响提供数据支持。 文件详解 数据文件（CSV格式）：...
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  • 河流生物膜微生物多样性测序技术比较分析数据集

    2025年12月9日 30 105 82

    数据集概述 本数据集为论文《Unlocking River Biofilm Microbial Diversity: Comparative Analysis of Sequencing Technologies》的原始数据，包含EA PacBio样本元数据、合并的长读长与短读长16S...
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  • EAW_16S_rRNA基因生物信息学课程FASTQ文件2018

    2025年12月6日 30 35 3

    数据集概述 本数据集包含二零一八年九月在意大利加尔达湖不同区域及深度采集的六个样本的十六S核糖体RNA基因测序数据，采用Illumina MiSeq技术生成，含正向（R1）和反向（R2）测序文件及相关描述文档，适用于生物信息学课程教学与实践。 文件详解 该数据集包含十四份文件，具体说明如下： - 描述文档: -...
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