数据集概述
本数据集通过RNA测序分析混合艾美耳球虫感染肉鸡的时序转录组,记录感染后4、7、21天的宿主免疫应答基因表达变化,定义三类差异表达基因,揭示内质网应激、先天免疫激活及细胞因子通路调控等机制,为鸡球虫病防控提供基因靶点参考,包含5个相关文件。
文件详解
- Supplymentary Materials 3 (Differentally expressed genes).xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录混合艾美耳球虫感染肉鸡在不同时间点的差异表达基因信息
- Supplymentary Materials 1 (Table S1, S2).docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:包含转录组分析相关的补充表格S1、S2,提供实验设计或基础数据支撑
- Supplymentary Materials 5 (GSEA analysis result files for 4 and 7 dpi).zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内为感染后4天、7天的基因集富集分析(GSEA)结果文件
- Supplymentary Materials 2 (Report for mapping reads).xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录转录组测序数据的reads比对报告,包含比对效率等关键信息
- Supplymentary Materials 4 (GO and KEGG analysis).xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含基因本体(GO)注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析结果
适用场景
- 家禽免疫学研究:分析肉鸡感染混合艾美耳球虫后的免疫应答基因表达时序变化
- 球虫病防控靶点筛选:基于差异表达基因及免疫调控枢纽基因,开发鸡球虫病防控的分子靶点
- 宿主-病原体互作机制研究:探究内质网应激、先天免疫激活等宿主与艾美耳球虫互作的关键生物学过程
- 转录组数据分析方法验证:为时序转录组、差异表达基因及通路富集分析提供实例数据支撑