数据集概述
本数据集来自关于减数分裂过程中动粒功能的研究,核心内容为验证保守Ctf19/CCAN动粒亚复合体抑制着丝粒近端交叉重组的机制,涉及酿酒酵母减数分裂DNA断裂形成及黏连蛋白富集对交叉重组的调控,数据包含测序分析结果与说明文档。
文件详解
- README_for_eLife_Dryad_Recombine_data.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录高通量测序数据分析信息,包括样本(WT、clb2-iml3四分子)、测序平台(Illumina HiSeq 2500)、图像分析流程(Illumina CASAVA_v1.8.0)、重组分析工具(ReCombine)及包含的文件夹(SegFiles、SegPlots)说明
- eLife_Dryad_Recombine_data.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包包含SegFiles(记录每个SNP位点四个孢子基因型,字段为Chr、pos、占位符、sporeA、spore_B、spore_C、spore_D)、SegPlots(四分子分离谱图,每组四行代表一个四分子的分离情况)
数据来源
论文“The kinetochore prevents centromere-proximal crossover recombination during meiosis”
适用场景
- 减数分裂交叉重组机制研究: 分析动粒对着丝粒近端交叉重组的抑制作用及分子调控路径
- 动粒功能验证: 验证Ctf19/CCAN复合体在减数分裂中的非经典功能(定义交叉重组 refractory 染色体域)
- 非整倍体发生机制分析: 探究着丝粒近端交叉与非整倍体配子生成的关联
- 高通量测序数据重组分析: 基于SegFiles与SegPlots数据开展减数分裂四分子基因型分离模式研究