数据集概述
本数据集围绕加州藜芦甾体生物碱生物合成展开，聚焦环巴胺前体藜芦嗪的合成途径研究。通过在Sf9细胞中重构候选基因，发现催化胆固醇生成藜芦嗪的四种关键酶，包含研究相关的文档和序列文件，总计2个文件。
文件详解
- README文档
- 文件名称：README_for_Augustin_etal_2015_p450.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明数据对应论文《Elucidating steroid alkaloid biosynthesis in Veratrum californicum: production of verazine in Sf9 cells》的背景，提及使用MAFFT进行序列比对、RAxML构建进化树的方法信息
- 序列归档文件
- 文件名称：Augustin_etal_2015_p450.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含full_p450_aligned_nucl.fsa文件，为基于密码子的P450编码序列比对数据
数据来源
论文“Elucidating steroid alkaloid biosynthesis in Veratrum californicum: production of verazine in Sf9 cells”
适用场景
- 植物甾体生物碱合成途径研究：分析加州藜芦中胆固醇到藜芦嗪的生物合成关键酶功能与催化步骤
- 药用植物分子育种：为环巴胺等甾体生物碱的生物工程可持续生产提供靶点参考
- 进化生物学分析：利用P450序列比对数据，研究相关酶的进化关系
- 生物合成酶功能验证：支持在异源系统（如Sf9细胞）中重构合成途径的实验设计与结果验证
