EoRNA_Based_大麦基因转录本丰度数据库数据

数据集概述

本数据集基于大麦参考转录本数据集BaRTv1.0,整合22项RNA-seq实验的843个样本数据,构建大麦基因表达数据库EoRNA。包含基因和转录本丰度(TPM值)、基因模型信息,支持通过基因名或BLAST查询,可用于分析品种、组织及条件特异性表达与可变剪接,提供可视化与数据提取功能。

文件详解

  • metadata_barley_rnaseq.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含大麦RNA-seq实验的样本元数据,可能涵盖样本来源、实验条件、组织类型、品种信息等描述性字段(具体字段需结合文件内容确认)
  • eorna_expt_tpms_matrix.txt.gz
  • 文件格式:TXT.GZ
  • 字段映射介绍:压缩格式的基因转录本丰度矩阵文件,存储所有样本中各基因/转录本的TPM(转录本每百万)值,支持基因表达量的直接提取与统计分析

数据来源

EoRNA (Barley Expression Database),基于BaRTv1.0参考转录本数据集及22项RNA-seq实验数据构建

适用场景

  • 大麦基因表达分析: 研究不同品种、组织或处理条件下的基因特异性表达模式
  • 可变剪接研究: 分析转录本比例变化,探究可变剪接事件的生物学意义
  • 分子生物学实验设计: 为大麦功能基因研究提供表达丰度的参考数据
  • 转录组meta分析: 提取TPM值进行多实验间的差异表达显著性分析与整合研究
  • 基因模型验证: 通过表达数据验证BaRTv1.0中转录本模型的有效性
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 264.1 MiB
最后更新 2026年1月31日
创建于 2026年1月31日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。