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白足鼠成纤维细胞LPS处理差异表达基因数据集
2026年2月1日 30 38 37
数据集概述 本数据集记录白足鼠(Peromyscus leucopus)成纤维细胞经脂多糖(LPS)或缓冲液处理后的差异表达基因(DEG)。实验识别出543个受LPS调控的基因,包含上调、下调基因的倍数变化及假发现率(FDR)p值,还列出对照组中TPM最高的10个蛋白编码基因,是研究白足鼠免疫应答分子机制的基础数据。 文件详解 README.txt...
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EoRNA_Based_大麦基因转录本丰度数据库数据
2026年1月31日 30 142 140
数据集概述 本数据集基于大麦参考转录本数据集BaRTv1.0,整合22项RNA-seq实验的843个样本数据,构建大麦基因表达数据库EoRNA。包含基因和转录本丰度(TPM值)、基因模型信息,支持通过基因名或BLAST查询,可用于分析品种、组织及条件特异性表达与可变剪接,提供可视化与数据提取功能。 文件详解...
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nf_core_rnaseq_Based_RNA_seq计数表测试数据
2026年1月26日 30 16 11
数据集概述 本数据集是基于GSE40419肺腺癌研究数据,通过nf-core/rnaseq流程生成的RNA-seq计数表示例,用于下游RNA-seq分析测试。包含22个文件,涵盖基因和转录本水平的表达结果、合并后的计数与TPM值文件、元数据及质控报告等,支持基因表达分析相关工具的测试验证。 文件详解 单样本结果文件...
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cephalochordate_Genome_五种头索动物基因组注释数据
2026年1月22日 30 57 18
数据集概述 本数据集包含五种头索动物(Asymmetron lucayanum、Branchiostoma belcheri、Branchiostoma floridae、Branchiostoma japonicum、Branchiostoma...
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Intensified_Based_畜禽集约化养殖粪便抗生素抗性基因型与表型研究数据
2026年1月18日 30 103 17
数据集概述 本数据集聚焦畜禽养殖集约化程度对粪便中抗生素抗性的影响,通过基因型和表型两种方法分析中国8个不同集约化程度农场(涵盖牦牛、绵羊、猪、马)的粪便样本,包含抗性基因多样性、耐药表型、可移动遗传元件关联及多药耐药特征等核心内容,共5个文件。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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X_chromosome_Based_哺乳动物X染色体基因表达限制与内容分析数据
2026年1月15日 30 37 31
数据集概述 本数据集围绕哺乳动物X染色体基因内容展开研究,探讨单倍体表达导致的最大表达水平限制对X染色体基因内容的影响。通过ENCODE和FANTOM5项目数据验证假设,分析X染色体与常染色体基因的最大表达差异、逆转录事件相关表达变化及组织特异性表达特征,包含14个相关文件。 文件详解 数据文件(.txt、.csv、.xlsx)...
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Phoenix_dactylifera_Based_椰枣品种NaCl胁迫转录组响应补充表格数据
2026年1月11日 30 148 111
数据集概述 本数据集为椰枣品种转录组响应研究的补充表格,包含Khalas和Sultana两个椰枣品种在NaCl胁迫下的转录组分析数据。实验通过盆栽培养椰枣幼苗,设置非盐胁迫和盐胁迫处理,采集根和茎组织进行RNA测序及生物信息分析,以探究其耐盐分子机制。 文件详解 文件名称:Palms_Pongrac_Fischer_White et...
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Wastewater_Based_南加州2020_2021年1600万人废水纵向宏转录组测序数据
2026年1月8日 30 106 27
数据集概述 本数据集为2020年8月至2021年8月南加州8个污水处理厂275份进水样本的纵向宏转录组测序数据,覆盖约1600万人口。数据包含微生物转录信息,涉及细菌、病毒、古菌的分类单元、代谢通路及2000余种抗生素耐药基因(AMR),可反映人群相关微生物的活性、耐药性及地理特征。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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Kallisto_v0_50_版本基于_P_parvum_12B1_菌株的昼夜相_RNA_去除_RNA_Seq_表达量定量数据
2025年12月27日 30 19 14
数据集概述 本数据集是使用Kallisto v0.50.0对P. parvum 12B1株昼夜相rRNA去除RNA-...
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nanoCAM_Gene_Based_基因表达与增强子调控完整数据
2025年12月23日 30 188 76
数据集概述 本数据集包含GM12878和K562细胞系的基因相关数据,涵盖样本基础信息、GpC可及性峰位置、多向增强子统计、基因位点与表达量化整合数据及差异表达基因列表,为基因相关研究提供支持。 文件详解 supplementarytable1_datasets_stat.xlsx:Excel格式,包含GM12878和K562细胞系重复样本的基础信息...
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肠细胞空间重建与肠道绒毛轴分区数据集
2025年12月19日 30 118 103
数据集概述 本数据集为“肠细胞空间重建揭示肠道绒毛轴广泛分区”研究的配套数据,包含激光捕获显微切割(LCM)基因表达、单细胞RNA测序(scRNAseq)原始计数、tSNE坐标及分区重建结果等文件,支持肠道绒毛细胞空间分布与基因表达模式的分析。 文件详解...
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甲壳动物肢体发育与再生基因表达动态补充数据集
2025年12月12日 30 85 35
数据集概述 本数据集为《甲壳动物肢体发育与再生过程中的基因表达动态》研究论文的补充数据,包含基因表达量、聚类分析结果、序列注释等多类型文件,支持论文结论的验证与扩展分析。 文件详解 数据文件(CSV格式,共26个):...
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绵羊免疫相关长链非编码RNA转录组学荟萃分析数据集
2025年12月6日 30 85 8
数据集概述 本数据集为绵羊免疫相关长链非编码RNA(lncRNA)转录组学荟萃分析研究的补充数据,包含lncRNA注释文件、基因表达量数据及研究相关的补充表格与材料,支持对绵羊免疫应答中lncRNA功能的深入分析。 文件详解 基因注释文件(GTF格式): lncrnas.gtf:所有新发现lncRNA转录本的注释文件...



