数据集概述
本数据集围绕北美中部高地Etheostoma zonale物种组的隐存种形成逆转现象展开,包含线粒体与核基因位点数据,用于分析类群系统发育关系、分化程度及基因渐渗对物种树推断的影响,涉及更新世种内分化、上新世隐存种及种间基因渐渗等研究内容,共含8个文件。
文件详解
- 压缩文件(Archive files)
- 文件名称:nuclearlociallindividualsmatrices.zip、nuclearlocifinalmatrices.zip、Starbeastxmlfiles.zip、ebspxmlfiles.zip、cytochromebmatrices.zip、nuclearlociinitialmatrices.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:分别存储核基因所有个体矩阵、核基因最终矩阵、Starbeast分析XML文件、EBSP分析XML文件、细胞色素b矩阵、核基因初始矩阵的压缩数据
- 表格文件(Data files)
- 文件名称:tableofnuclearsequences.xlsx、tableofcytochromebsequences.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 内容说明:记录核基因序列信息与细胞色素b序列信息的表格数据
数据来源
论文“Cryptic speciation reversal in the Etheostoma zonale (Teleostei: Percidae) species group, with an examination of the effect of recombination and introgression on species tree inference”
适用场景
- 鱼类系统发育研究:分析Etheostoma zonale物种组内类群的系统发育关系与分化时间
- 隐存种形成逆转机制探究:基于基因渐渗数据研究物种形成逆转的分子证据与过程
- 基因渐渗对物种树推断影响分析:评估线粒体与核基因渐渗在系统发育分析中的干扰效应
- 种群遗传学分析:利用核基因与线粒体数据研究物种内种群分化及更新世演化历史
- 分子进化模型验证:通过Starbeast、EBSP等分析文件测试不同系统发育模型的适用性