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标签: 物种树推断

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  • 异源多倍体同源基因亲本基因组分配与物种树推断数据集_烟堇属案例

    2025年12月7日 30 172 85

    数据集概述 本数据集围绕异源多倍体物种中同源基因向亲本基因组的分配方法展开，旨在解决复杂进化历史下的物种树推断问题。以植物烟堇属（罂粟科）为研究案例，包含用于基因组系统发育分析的序列比对文件及补充说明文档，为多倍体物种的网状进化关系研究提供数据支持。 文件详解 核心序列文件（.nex格式）：...
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  • 墨西哥跨墨西哥火山带山地丛生草蜥蜴Sceloporus_subniger的隐秘多样性数据集

    2025年12月5日 30 183 48

    数据集概述 该数据集围绕墨西哥跨墨西哥火山带分布的山地丛生草蜥蜴Sceloporus subniger的隐秘多样性展开，包含线粒体DNA、UCE基因组数据及形态学测量结果，用于验证该物种是否为复合种，支持新物种描述的遗传与形态学证据。 文件详解...
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  • 概率物种树距离数据集

    2025年12月4日 30 93 78

    数据集概述 该数据集围绕概率物种树距离方法展开，基于多物种溯祖模型（MSC），将基因树距离理论扩展至物种树模型比较，包含相关补充材料，为系统发育树模型的概率化比较研究提供支持。 文件详解 文件名称：SupplementaryFigure01_11Dec2018.pdf 文件格式：PDF...
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  • 细趾蝾螈物种树推断影响因素实证研究数据集

    2025年12月4日 30 162 116

    数据集概述 本数据集围绕细趾蝾螈（Batrachoseps）的物种树推断展开，包含22个物种的5个核基因与1个线粒体基因数据，用于分析推断方法、种群取样及基因取样对物种树拓扑结构的影响，为研究不同方法在实证数据中的表现提供支持。 文件详解 分析脚本与说明文件：...
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  • 两步法多物种溯祖模型全似然物种树推断数据集

    2025年12月4日 30 5 3

    数据集概述 该数据集包含用于两步法多物种溯祖模型全似然物种树推断的模拟与分析脚本，支持基因树生成、DNA序列模拟及五种基于溯祖模型的物种树估计方法的数据分析。 文件详解 文件名称：two-step_msc.zip 文件格式：ZIP压缩包 内容说明：压缩包内包含两类脚本，一是模拟脚本（生成带不完全谱系分选的基因树、基于Jukes-...
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