数据集概述
本数据集为Schmid-Siegert等2021年发表于《传染病杂志》的研究提供支持,聚焦肺炎患者中耶氏肺孢子菌主要表面糖蛋白超家族的表达模式,包含基因序列、样本数据、实验分析等相关文件,用于研究该菌表面糖蛋白的表达特征及生物学意义。
文件详解
该数据集包含6个独立文件,具体说明如下:
- 文档类文件:
- Sequences used for Weighter profiles generation.docx:DOCX格式,用于生成Weighter谱的基因序列文件
- RNA seq depostion in SRA archive SUB6951026.pdf:PDF格式,记录RNA测序数据在SRA数据库(存档号SUB6951026)的提交信息
- 数据类文件:
- MSGs_list_Emanuel_24082016 with RPKM for Schmid et al 2017 Mbio.xls:XLS格式,包含耶氏肺孢子菌主要表面糖蛋白(MSGs)列表及对应RPKM表达量数据
- Data haplotype cov.xls:XLS格式,单倍型覆盖度数据文件
- Desciption samples for NCBI deposition.xlsx:XLSX格式,用于NCBI数据库提交的样本描述文件
- data fig 2 cutoff window.xls:XLS格式,图2分析所用的截断窗口数据文件
适用场景
- 微生物学研究:分析耶氏肺孢子菌主要表面糖蛋白超家族的基因表达特征
- 感染病学研究:探究肺炎患者中该菌表面糖蛋白的表达模式与疾病的关联
- 基因序列分析:基于提供的序列文件开展相关生物信息学分析
- 实验数据复现:支持Schmid-Siegert等2021年研究论文的实验结果验证与扩展分析