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标签: NCBI数据库

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  • 硬质小麦盐胁迫下表型根系结构的基因型变异数据

    2026年2月9日 30 184 151

    数据集概述 本数据集为硬粒小麦在盐胁迫下根系表型多样性与基因型变异研究的补充数据,包含盐胁迫和对照条件下表型性状的主成分值、与QTL关联的标记在参考基因组上的位置、与NCBI数据库基因关联的标记及PCR结果与等位基因分布,共1个Excel文件。 文件详解 文件名称:WP2_T2.1_UNITUS_RSA and salt stress durum...
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  • Penion_Based_海洋海螺谱系识别与进化模式研究数据

    2026年1月29日 30 181 107

    数据集概述 本数据集围绕新西兰Penion海洋海螺展开,整合现存物种的遗传与贝壳形态变异数据,并结合化石分析谱系识别对进化模式的影响。数据验证了遗传与形态变异的一致性,发现部分分类过度拆分及化石标本错误归类问题,揭示谱系识别对进化模式认知的关键作用。 文件详解 遗传分析文件...
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  • PrimerMiner_Based_COI引物开发与验证参考数据

    2026年1月28日 30 122 65

    数据集概述 本数据集是R包PrimerMiner的配套数据,用于DNA宏条形码引物的开发与计算机模拟验证。包含COI基因的参考序列数据,通过批量下载BOLD和NCBI数据库的序列并聚类为操作分类单元(OTUs)生成,支持针对特定类群或生态系统的引物优化,解决现有工具缺乏批量处理参考序列的问题。 文件详解 COI Folmer region.zip...
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  • EST_SSR_IUCN_Based_濒危植物分子标记数据库_存档

    2026年1月27日 30 79 58

    数据集概述 本数据集是基于NCBI公共EST数据库开发的濒危植物EST-SSR标记资源,涵盖IUCN红色名录257个属的14498726条EST序列,识别出17102个可直接测试的EST-SSR标记,涉及193个植物属。数据支持濒危植物的遗传多样性研究、种群遗传学分析及跨物种标记转移应用。 文件详解 文件名称:README_for_Type I...
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  • NGS_Based_舞毒蛾与僧尼蛾表达序列标签数据集_2013_2014

    2026年1月21日 30 167 141

    数据集概述 本数据集基于NGS技术生成,包含舞毒蛾(Lymantria dispar)和僧尼蛾(Lymantria monacha)两种近缘鳞翅目林业害虫的表达序列标签数据,两种害虫对寄生蜂Glyptapanteles liparidis的寄生响应存在差异。数据集共6个文件,涵盖注释、比对、BLAST结果、实验方案及脚本、表格和重叠群等内容。 文件详解...
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  • Mosquito_COI_哥伦比亚安第斯山脉蚊种DNA条形码与形态学鉴定补充材料2015

    2026年1月13日 30 188 81

    数据集概述 本数据集为论文补充材料2,包含从NCBI和BOLD数据库下载的蚊类COI基因序列,用于哥伦比亚安第斯山脉三个生态系统的蚊种鉴定。序列筛选条件为长度≥480bp、无终止密码子且可与多数序列对齐,共1159条。其中蓝色标注部分为新热带区无可用序列类群的其他地理区域补充序列。 文件详解 文件名称:oo_47229.docx 文件格式:DOCX...
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  • 来自_PhytoKeys_的补充材料1_2020年Ceratozamia物种研究基因序列登录号数据

    2026年1月7日 30 95 25

    数据集概述 本数据集为论文《墨西哥南马德雷山脉Ceratozamia新种研究》的补充材料1,包含ITS和matK基因序列的GenBank登录号,其中本研究生成的序列以粗体标注,用于支持该植物新种的分子系统学分析,共包含1个文件。 文件详解 文件名称:oo_444870.docx 文件格式:DOCX...
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  • µgreen_db光合微生物23S_rRNA基因参考数据库

    2025年12月23日 30 173 86

    数据集概述 该数据集是一个针对23S rRNA基因的参考数据库(µgreen-db),用于光合微真核生物和原核蓝细菌群落的分类学分析。数据来源于NCBI、SILVA、CRW数据库及递归BLAST搜索,包含约两千余条23S rRNA序列,覆盖四百余种属的光合微生物,可实现土壤DNA宏条形码序列的高比例属水平分类分配。 文件详解 数据库压缩包文件:...
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  • 地中海新兴非土著物种星座聚枝螅COI序列分析表2

    2025年12月23日 30 44 42

    数据集概述 该数据集为Table 2,包含2021年9月21日从NCBI nt-nr数据库获取的星座聚枝螅等物种的COI序列分析结果,标注了错误分类序列及研究涉及的单倍型,用于地中海非土著物种的分类学研究与DNA条形码数据验证。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段映射:...
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  • 俄勒冈州持证肉鸡生产系统沙门氏菌多样性及全国流行菌株关联研究补充数据集

    2025年12月22日 30 1 0

    数据集概述 本数据集为研究论文的补充数据,聚焦俄勒冈州持证肉鸡生产系统中沙门氏菌的多样性,及其与全国流行菌株的关联。包含7个不同格式的文件,覆盖调查文件、基因组数据、SNP分析等内容,为研究提供完整数据支撑。 文件详解 Supplementary Data 1 - Oregon state-licensed poultry slaughterhouse...
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  • 加勒比海蛞蝓分类研究样本编码与基因登录号数据集

    2025年12月21日 30 126 84

    数据集概述 本数据集为加勒比海蛞蝓分类研究的配套表格数据,记录了Cyerce antillensis复合群中6个物种的样本编码、单倍型编码及对应基因标记(COI、16S、H3)在NCBI数据库的登录号,用于支持物种亲缘关系分析。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段内容:...
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  • 甲型流感病毒K_mer基高效基因组监测数据库

    2025年12月18日 30 105 100

    数据集概述 本数据集为甲型流感病毒基因组监测设计的K-mer基数据库,包含50个亚型的独特子序列,涵盖18种血凝素(HA)和11种神经氨酸酶(NA)亚型。基于NCBI 2022年5月数据构建,通过泛基因组工具生成亚型特异性及共享序列,支持高效亚型分类。 文件详解...
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  • 鳞翅目夜蛾总科选定物种线粒体基因组比较数据集

    2025年12月15日 30 77 3

    数据集概述 该数据集包含19种夜蛾总科物种的完整线粒体基因组序列及其注释数据,涉及遗传组成分析与分子特征研究。结合NCBI数据库数据,探究该类群的系统发育关系,为夜蛾总科的分类学与系统发育研究提供分子依据。 文件详解 基因组序列文件: GENBANK FLAT FILES 19 SPECIES.zip:...
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  • 牛粪便_土壤及施肥土壤样本的111个宏基因组组装基因组数据集

    2025年12月14日 30 170 57

    数据集概述 本数据集包含111个宏基因组组装基因组(MAGs)的序列及相关信息,样本来源为抗生素预防下奶牛新鲜粪便、两个有机农场牧场土壤及施肥土壤构建的微宇宙。数据支持微生物组分类、功能及生态关联研究。 文件详解 文件名称: MAGs_FASTA_files.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容: 包含所有宏基因组组装基因组的FASTA序列文件...
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  • ARCHS4_Based_DeepSeqDock支撑信息分析完整数据

    2025年12月8日 30 170 134

    数据集概述 本数据集是DeepSeqDock系统测试用数据集的支撑信息,包含探索性数据分析报告及CSV文件,数据子集源自ARCHS4数据集,相关元数据来自Ma'ayan实验室平台或NCBI数据库,为理解DeepSeqDock系统测试数据提供支持。 文件详解...
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  • 肺炎患者中耶氏肺孢子菌主要表面糖蛋白超家族表达模式数据集

    2025年12月4日 30 97 91

    数据集概述 本数据集为Schmid-Siegert等2021年发表于《传染病杂志》的研究提供支持,聚焦肺炎患者中耶氏肺孢子菌主要表面糖蛋白超家族的表达模式,包含基因序列、样本数据、实验分析等相关文件,用于研究该菌表面糖蛋白的表达特征及生物学意义。 文件详解 该数据集包含6个独立文件,具体说明如下: - 文档类文件: - Sequences used...
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  • 水平获得的脂肪酸去饱和酶进化使弹尾目生物合成ω_3多不饱和脂肪酸数据集

    2025年11月27日 30 157 132

    数据集概述 本数据集围绕弹尾目(Collembola)中水平获得的脂肪酸去饱和酶进化展开,包含序列信息、分类学数据、质谱原始数据等,支持研究其ω-3多不饱和脂肪酸生物合成机制,为相关分子进化与功能分析提供数据基础。 文件详解 DatasetsS1.xlsx:Excel格式,弹尾目脂肪酸去饱和酶和延长酶序列的汇总信息...
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  • 霍乱弧菌补充表数据集

    2025年11月27日 30 168 106

    数据集概述 本数据集包含4个补充表格文件,围绕霍乱弧菌(V. cholerae)的基因组、临床分离株、基因信息等主题展开,为霍乱弧菌相关研究提供结构化的补充数据支持。 文件详解 该数据集包含1个目录及4个文件,具体说明如下: - 目录:Supplementary Table V. Cholerae/ - 文件列表: - Supplementary...
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