数据集概述
该数据集包含用于重新发现和确定Feliciadamia stenocarpa（野牡丹科Feliciadamieae属）系统基因组学位置的相关数据、流程、脚本及输出文件，支持植物分类学与系统发育研究。
文件详解
- 脚本文件：
- target_scripts.zip：压缩文件，包含目标捕获分析相关脚本
- 流程说明文件：
- Feliciadamia_target_capture_pipeline.md：Markdown文件，目标捕获分析流程文档
- Feliciadamia_skimming_pipeline.md：Markdown文件，基因组浅层测序分析流程文档
- 序列数据文件：
- target_alignments.zip：压缩文件，目标捕获序列比对结果
- plastomes.fasta：FASTA格式文件，质体基因组序列
- 输出结果文件：
- target_phylogeny_outputs.zip：压缩文件，目标捕获系统发育分析结果
- skimming_output.zip：压缩文件，基因组浅层测序分析结果
- target_paralogs_all.zip：压缩文件，目标捕获分析中的旁系同源基因数据
- 原始数据文件：
- skimming_data.zip：压缩文件，基因组浅层测序原始数据
适用场景
- 植物分类学研究：用于Feliciadamia stenocarpa物种的重新发现与分类地位确认
- 系统发育分析：支持野牡丹科Feliciadamieae属的系统基因组学定位研究
- 基因组学方法应用：可作为目标捕获与基因组浅层测序技术在植物系统学中应用的案例数据
- 植物进化研究：为探讨相关类群的进化关系提供数据支持
