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硅藻质体基因组进化研究数据
2026年2月12日 30 199 43
数据集概述 本数据集为硅藻质体基因组进化研究的补充信息，包含22个已发表和18个新报道的硅藻质体基因组序列，覆盖基因组大小、基因含量、基因重排等特征，以及基于103个共享质体编码基因构建的硅藻系统发育树，用于分析硅藻主要类群的系统发育关系、基因丢失事件及序列分歧与基因顺序变化的相关性。 文件详解...
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Dryad_Based_沼泽兰边缘种群遗传多样性研究数据
2026年1月30日 30 66 21
数据集概述 本数据集为沼泽兰（Dactylorhiza majalis ssp. majalis）边缘种群遗传多样性研究的基础数据，包含中欧8个种群与斯堪的纳维亚10个种群共220株植物的遗传标记数据，涉及核微卫星位点、核ITS及质体基因组非编码区多态性位点的检测结果，用于分析边缘种群与核心种群的遗传多样性差异及分化模式。 文件详解 文件名称：Base...
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Oatk_Based植物细胞器基因组从头组装工具配套数据
2026年1月30日 30 84 38
数据集概述 本数据集包含195个植物细胞器基因组组装数据，涵盖24种单子叶植物、154种真双子叶植物、16种苔藓和1种苔类。数据由Sanger Institute的生命之树项目（主要来自达尔文生命之树项目）生成，用于支持论文“Oatk: a de novo assembly tool for complex plant organelle...
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盐生植物线粒体基因组分析补充材料2_同义密码子使用数据_2021
2026年1月28日 30 121 6
数据集概述 本数据集为论文《Sea Lavenders质体基因组分析揭示IR扩张与正选择》的补充材料2，包含Limonium（Sea Lavenders）质体基因组的相对同义密码子使用数据，用于分析该植物类群的密码子偏好性特征，支持其基因组进化研究。 文件详解 文件名称：oo_527176.xlsx 文件格式：XLSX...
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Sorbus_Based波罗的海地区花楸属中间物种多独立起源研究数据
2026年1月27日 30 154 81
数据集概述 本数据集围绕波罗的海地区花楸属（Sorbus）中间物种展开，研究其是否为本地独立起源、形态与分子层面的独特性及无融合生殖能力。涵盖6个中间种群的核与质体微卫星位点变异、形态分化、倍性水平及子代稳定性数据，是分析该区域花楸属物种形成机制的核心分子基础资料。 文件详解 文件名称：Molecular base data Sorbus.xlsx...
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Senecio_carniolicus_Based_多倍体起源分析数据
2026年1月26日 30 65 16
数据集概述 本数据集包含用于分析高山植物Senecio carniolicus多倍体起源模式的分子数据及分析代码，涵盖ITS序列、质体序列、AFLP矩阵等分子数据，以及用于模拟多倍体起源的R脚本和AFLP数据压缩包，支持通过AFLP数据推断多倍体是同源还是异源起源。 文件详解 Senecio_carniolicus_ITS_sequences.nex...
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NOVOWrap_Based_质体基因组组装与结构标准化软件测试数据
2026年1月23日 30 20 6
数据集概述 本数据集为质体基因组组装工具NOVOWrap的测试数据，包含该软件在11种植物（石松类、裸子植物、被子植物）上的基准测试结果，涉及组装结果验证、注释、模块性能评估等内容，支持研究者验证软件功能及获取标准化基因组数据。 文件详解...
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Soldanella_Based_欧洲高山植物基因渐渗与物种分化研究数据
2026年1月22日 30 64 56
数据集概述 本数据集聚焦欧洲高山植物Soldanella属（报春花科）的基因渐渗研究，整合了质体基因组、核基因组（RAD-seq）及细胞遗传学数据，分析杂交与渐渗在该属快速分化中的作用。数据覆盖属内物种演化历史中的基因流动模式，尤其关注喀尔巴阡物种的核型变异与渐渗程度，揭示杂交对物种形成和遗传多样性的影响。 文件详解 README文件...
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Pelargonium_Based_质体基因组结构类型与重排历史研究数据
2026年1月21日 30 48 31
数据集概述 本数据集源自对牻牛儿苗科Pelargonium属60个物种质体基因组（plastome）的研究，通过PCR和测序方法分析所有质体重排热点区域，揭示出四种不同的质体基因组结构类型，涉及基因重排、微结构变化、重复DNA及核苷酸替代率等内容，为理解该属特殊质体基因组的进化路径提供数据支持。 文件详解 Alignments_seqData.zip...
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Limonium_Based_海薰衣草质体基因组正选择基因列表数据2021
2026年1月21日 30 73 46
数据集概述 本数据集为论文的补充材料3，包含海薰衣草（Limonium属）质体基因组中被鉴定出的正选择基因列表，是研究该属植物质体基因组倒位重复区扩展及适应性进化的关键数据支撑。 文件详解 文件名称：oo_527177.xlsx 文件格式：XLSX...
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Hippeastreae_Based_植物二倍体系统发育与杂交事件研究数据
2026年1月21日 30 89 56
数据集概述 本数据集为石蒜科Hippeastreae族二倍体类群的系统发育研究数据，包含通过杂交富集和下一代测序获得的18个核基因座、近完整质体基因组及39个自动组装基因座数据，用于分析该类群的进化关系、基因树异质性及核质不一致性，探究古老杂交事件和不完全谱系分选的影响。 文件详解 代码文件...
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Dactylorhiza_umbrosa_亚洲小亚细亚湿地兰基因扩散研究数据
2026年1月20日 30 97 2
数据集概述 本数据集围绕亚洲小亚细亚湿地兰Dactylorhiza umbrosa展开，聚焦种子与花粉对基因扩散的不对称贡献。通过分析质体基因组（种子传播）和核基因组（种子与花粉共同传播）的遗传分化，探究地理距离对花粉与种子扩散比率（mp/ms）的影响，以及冰期后遗传多样性结构的形成规律，为陆生兰科植物基因流动研究提供基础数据。 文件详解...
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Campanulastrum_Based_美洲风铃草质体基因组进化机制研究数据
2026年1月19日 0 44 43
数据集概述 本数据集围绕美洲风铃草质体基因组展开，包含基因序列比对、PAML分析输入输出等文件，用于研究种间分化与种内多态性的相关性，探索快速进化质体基因组在跨时间尺度下的相似进化机制，涉及基因选择压力、结构变异等核心内容。 文件详解 单基因比对文件 文件名称：SingleGeneAlignments.zip 文件格式：ZIP（内含文本文件）...
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Limonium_Plastome_Based质体基因组重复分析补充数据2021
2026年1月19日 30 136 94
数据集概述 本数据集是论文《Plastome analysis unveils Inverted Repeat (IR) expansion and positive selection in Sea Lavenders》的补充材料1，包含四种Limonium植物质体基因组的重复分析结果，为研究该属植物质体基因组结构特征提供数据支持。 文件详解...
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Mechanistic_Model_Based_植物非光合生活方式进化速率变化机制研究数据
2026年1月17日 30 1 0
数据集概述 本数据集为植物从自养向非光合寄生生活方式转变过程中质体基因组进化速率变化的机制模型相关数据，包含10个Excel数据文件及1个分析脚本压缩包，涉及进化速率、选择压力与基因丢失等分子进化特征分析，可支撑植物寄生生活方式进化机制的研究。 文件详解 数据文件（.xlsx格式，共10个）...
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Adiantum_Pteridaceae_based_铁线蕨属质体RNA编辑频率变异研究数据
2026年1月17日 30 117 105
数据集概述 本数据集记录了铁线蕨属（Adiantum）三种植物（A. aleuticum、A. shastense、A. capillus-veneris）的质体RNA编辑位点信息。通过比较三种植物的编辑位点数量、位置及类型差异，揭示铁线蕨属内RNA编辑频率的快速进化特征，为蕨类植物质体基因组研究提供基础数据。 文件详解...
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TraitRateProp_Based_表型性状与序列进化关联分析数据_研究材料
2026年1月15日 30 148 110
数据集概述 本数据集是研究表型性状变化与位点特异性序列进化关联的配套数据，包含应用TraitRateProp方法分析的兰花质体基因及OM基因结果、补充表格和修订补充材料。其中TraitRateProp是用于检测二元表型性状与序列进化速率关联的概率方法，数据集支持验证该方法及研究异养生活方式对植物质体基因组进化的影响，共含5个文件。 文件详解...
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Dryad_Based_Distephanus属分子系统发育与新分类单元研究数据
2026年1月15日 30 134 81
数据集概述 本数据集为Distephanus属分子系统发育研究的配套数据，包含4个核基因组和质体基因组分子标记的多序列比对文件、生物地理分析脚本、地理数据及时间校准分化时间分析配置文件，共8个文件。数据支持验证Distephanus属单系性、划分新分类单元Distephaneae族的研究结论。 文件详解 序列比对文件（.fasta格式）...
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Orchidaceae_Phylogenetic_转录组挖掘315个单拷贝直系同源基因串联数据
2026年1月12日 30 68 60
数据集概述 本数据集为兰科植物系统发育分析提供转录组挖掘的315个单拷贝直系同源基因串联数据。选取覆盖兰科5个亚科的10个代表物种，提取其转录组中的单拷贝直系同源基因用于构建系统发育树，解决传统方法在退化质体基因组物种定位上的难题，为兰科植物系统发育研究提供高效可靠的基因资源。 文件详解 文档文件...
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Rubioideae_Phylogenomics_Based_茜草亚科质体系统发育与核质不一致性研究数据
2025年12月31日 30 50 4
数据集概述 本数据集基于核基因组目标捕获测序项目的脱靶 reads 构建质体基因组系统发育树，探究茜草科茜草亚科的进化关系及核质不一致性。包含一百二十个质体基因组序列，通过公共双端 Illumina 测序数据组装得到，支持亚族内及亚族间多数关系的解析，识别出核质不一致案例，为植物系统发育研究提供数据支撑。 文件详解 README.md 文件格式：MD...
