数据集概述
本数据集基于两种近缘斑姬鹟(Ficedula albicollis和F. hypoleuca)多个种群的全基因组连锁不平衡(LD)模式,估算了精细尺度的种群重组率。数据揭示了物种间重组景观的保守性与局部差异,分析了遗传多样性、分化与重组率的关联,识别了种群特异性重组热点及其与CpG岛、转座元件的关联机制,为鸟类重组调控机制研究提供支撑。
文件详解
- 文件名称:flycatcher_rho.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:压缩包内包含与斑姬鹟种群全基因组连锁不平衡分析相关的数据,具体字段需解压后查看,推测涵盖种群重组率、连锁不平衡模式、遗传多样性、分化指标、重组热点位置及关联基因组元件(CpG岛、转座元件)等信息。
适用场景
- 鸟类基因组重组机制研究:分析两种斑姬鹟种群重组率的精细尺度变异及物种间保守性与差异。
- 连锁选择与遗传多样性关联分析:探究不同谱系中重组率对遗传多样性和种群分化的影响。
- 重组热点调控因素研究:验证CpG岛、转座元件等基因组元件与重组热点的关联机制。
- 表观遗传景观进化分析:探索转座元件分布、重组率变异与表观遗传景观演化的关系。
- 种群遗传学模型构建:为鸟类种群遗传结构及进化动态的模型构建提供基础数据。