数据集概述
本数据集为Litz等人研究的附加数据，聚焦O型口蹄疫病毒（FMDV）在牛持续感染过程中的基因组突变。包含7个文件，涵盖序列比对、元数据、进化树等类型，记录病毒基因组变异、样本信息及实验关联数据，支持病毒基因组进化与持续感染机制研究。
文件详解
- CSV文件（共2个）
- 文件名称：NT_alignment_FMDV_ORF_consensus-level_Metadaten_Litz.csv
- 字段映射：包含序列ID、动物ID、感染后天数（DPI）、样本材料、感染阶段等元数据字段
- 文件名称：00_data_overview.csv
- 字段映射：包含文件编号、文件名、简要描述、详细描述、文件格式、所用软件、数据关系等数据概览字段
- FASTA文件（共2个）
- 文件名称：NT_alignment_FMDV_ORF_consensus-level_Litz.fasta
- 内容说明：O型口蹄疫病毒ORF共识序列比对结果
- 文件名称：NT_alignment_FMDV_ORF_consensus-level_Animal758_Litz.fasta
- 内容说明：758号动物的O型口蹄疫病毒ORF共识序列比对结果
- Treefile文件（共2个）
- 文件名称：NT_alignment_FMDV_ORF_consensus-level_Litz.fasta.treefile
- 内容说明：O型口蹄疫病毒序列进化树文件
- 文件名称：NT_alignment_FMDV_ORF_consensus-level_Animal758_Litz.fasta.treefile
- 内容说明：758号动物的病毒序列进化树文件
- XLSX文件（共1个）
- 文件名称：NT_alignment_FMDV_ORF_consensus-level_Metadaten_Litz.xlsx
- 内容说明：O型口蹄疫病毒ORF共识序列比对元数据表格
数据来源
Litz等人研究：Distinct mutations emerge in the genome of serotype O foot-and-mouth disease virus during persistence in cattle
适用场景
- 病毒基因组突变分析: 研究O型口蹄疫病毒在牛持续感染过程中的基因组变异位点与规律
- 病毒持续感染机制研究: 结合样本感染阶段、DPI等元数据，分析突变与病毒持续感染的关联
- 病毒进化树构建: 利用FASTA序列与treefile文件，开展病毒株系进化关系分析
- 实验数据整合: 通过数据概览文件关联不同类型数据，支持多维度病毒学实验分析
- 动物感染模型研究: 基于不同动物ID的样本数据，探究个体差异对病毒突变的影响
