数据集概述
本数据集为美国东南部松林生态实验数据,通过对比甲虫可进入与排除的松树树干,分析木蛀甲虫对真菌群落组装及木材分解的影响。包含真菌培养数据、高通量DNA/RNA元条形码测序数据及木材分解相关统计数据,共8个文件,用于验证甲虫在森林碳循环中的作用机制。
文件详解
- 真菌测序数据文件
- 文件名:supplement2_ITS2_OTUs.fa、supplement1_LSU_OTUs.fa
- 文件格式:FA
- 字段映射介绍:分别存储ITS2和LSU标记的真菌操作分类单元(OTU)序列数据
- 真菌分类单元表文件
- 文件名:its.otu_table.taxonomy.csv、lsu.otu_table.taxonomy.csv、lsu_rna_dna_otu_table.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含OTU ID及不同样本(如Hulcr_control、t0_1B等)的分类单元丰度与分类学信息
- 木材分解与培养数据文件
- 文件名:wood_final.csv、wood_culture.csv、beetle_culture_CFUs.xlsx
- 文件格式:CSV、XLSX
- 字段映射介绍:记录木材分解相关统计数据、木材真菌培养数据及甲虫携带真菌的菌落形成单位(CFU)统计
适用场景
- 森林生态系统碳循环研究: 分析木蛀甲虫对木材分解及碳释放的影响机制
- 真菌群落生态学研究: 探究甲虫介导的真菌群落组装规律与物种互作关系
- 森林病虫害生态效应评估: 评估木蛀甲虫对森林生态系统功能的实际影响
- 分子生态学方法论验证: 比较ITS2与LSU标记在真菌群落分析中的应用效果