数据集概述
本数据集为《辅助NLR通道细胞器钙触发植物免疫》手稿的补充数据，包含13个文件，涵盖氨基酸序列、钙传感器强度原始数据、系统发育树等内容，支持植物免疫机制相关研究。
文件详解
- 氨基酸序列与比对文件：
- Data_S1.zip（压缩包）：NbNRG1与AtNRG1的氨基酸比对数据
- Data_S6.fasta（FASTA）：用于系统发育分析的NB-ARC结构域氨基酸序列
- Data_S7.afa.zip（压缩包）：用于系统发育分析的NB-ARC结构域氨基酸比对数据
- Data_S11.zip（压缩包）：四个CCR分支RPW8 CC结构域的氨基酸序列及MEME输出结果
- 原始数据文件：
- Data_S2.xlsx（Excel）：钙传感器强度原始数据
- Data_S3.xlsx（Excel）：HR 800 nm荧光原始数据
- 元数据文件：
- Data_S4.xlsx（Excel）：本研究使用的基因组分类学及元数据
- Data_S5.xlsx（Excel）：系统发育分析所用基因的氨基酸序列及元数据
- 系统发育树文件：
- Data_S8.newick（Newick）：所有系统发育分析基因的系统发育树
- Data_S9.zip（压缩包）：RefSeq CCR-NLRs与Chia et al. (2024)提取序列的系统发育树
- Data_S10.zip（压缩包）：RefSeq CCR-NLRs、Chia et al. (2024)提取序列及蚕豆、野生大豆序列的系统发育树
- 结构模型与HMM文件：
- Data_S12.zip（压缩包）：四个CCR分支N端基序的隐马尔可夫模型（HMM）谱及HMMsearch输出结果
- Data_S13.zip（压缩包）：CC-NLR抗病小体结构模型的AF3数据
适用场景
- 植物免疫学研究：分析NLR蛋白介导的钙信号通路与免疫触发机制
- 分子进化分析：基于氨基酸序列及系统发育树探究CCR-NLR家族的进化关系
- 生物信息学建模：利用HMM谱及结构模型数据构建植物抗病蛋白的结构功能关联模型
- 细胞生物学研究：通过钙传感器及荧光原始数据解析细胞器钙信号对免疫反应的调控作用
