数据集概述
本数据集为壁虎昼夜活动模式进化研究的相关数据，包含系统发育分析、特征进化模拟等所需的基因数据、系统发育树及分析输入文件，支持探究壁虎昼夜活动模式的进化历史，包括夜行性的古老起源及多次向昼行性的转变过程。
文件详解
- BiSSE_unresolved_data.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含tip.label（分类单元标签）、Nc（分类单元数量）、n0（夜行性状态数量）、n1（昼行性状态数量）等字段，记录不同壁虎分类单元的昼夜活动状态数据
- BayesTraits_binary.data.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：用于BayesTraits分析的二进制数据文件，记录壁虎昼夜活动模式的二元特征数据
- Diurnality_6gene_data.nexus
- 文件格式：NEXUS
- 字段映射介绍：包含6个基因序列的系统发育分析数据文件，用于构建壁虎的系统发育关系
- BiSSE_Pruned_BEAST_phylogeny.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：经过修剪的BEAST系统发育树文件，记录壁虎的时间校准系统发育关系
- Diurnality_6gene.part1.Yule.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：BEAST分析的XML输入文件，采用Yule模型，用于6基因数据的系统发育分析设置
- BayesTraits_3char.data.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：用于BayesTraits分析的三特征数据文件，记录壁虎昼夜活动模式相关的多特征数据
- BEAST_5k_prune_Trees.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：包含5000棵修剪后的BEAST系统发育树的文件，用于系统发育不确定性分析
数据来源
论文“Into the light: diurnality has evolved multiple times in geckos”
适用场景
- 壁虎进化生物学研究: 分析壁虎昼夜活动模式的进化历史，探究夜行性的起源及昼行性的多次独立进化
- 生物特征进化模拟: 利用BiSSE模型等分析工具，模拟壁虎昼夜活动模式的进化转变过程
- 系统发育关系构建: 基于6基因数据构建壁虎的时间校准系统发育树，研究壁虎的分类与进化关系
- 生态适应性研究: 结合昼夜活动模式与环境数据，探究壁虎对不同光照、温度环境的适应性进化机制
- 进化生理学研究: 基于昼夜活动模式的进化历史，指导壁虎视觉、生理适应特征的研究方向
