Genome_Transcriptome_Based_Calanus物种核插入缺失标记开发数据

数据集概述

本数据集为Calanus属桡足类物种鉴定的核插入缺失标记开发相关数据,基于C. finmarchichus和C. glacialis两个近缘物种的基因组与转录组测序分析,包含12个物种特异性扩增子长度标记的开发成果,可用于Calanus属多个物种及杂交种的分子鉴定,共含5个文件。

文件详解

  • Msat_Genotypes_SuppInfo.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:未提供具体字段信息,推测包含微卫星基因型相关的补充信息
  • Cgla_Transcriptome_Contigs.fasta
  • 文件格式:FASTA
  • 字段映射介绍:C. glacialis转录组组装的Contigs序列文件
  • Cgla_Genome_Contigs.fasta
  • 文件格式:FASTA
  • 字段映射介绍:C. glacialis基因组组装的Contigs序列文件
  • Cfin_Transcriptome_Contigs.fasta
  • 文件格式:FASTA
  • 字段映射介绍:C. finmarchichus转录组组装的Contigs序列文件
  • Cfin_Genome_Contigs.fasta
  • 文件格式:FASTA
  • 字段映射介绍:C. finmarchichus基因组组装的Contigs序列文件

数据来源

论文“Genome- and transcriptome-assisted development of nuclear insertion/deletion markers for Calanus species (Copepoda: Calanoida) identification”

适用场景

  • 海洋浮游生物分类鉴定: 利用物种特异性插入缺失标记,实现Calanus属多个物种的分子鉴定
  • 海洋生态系统研究: 基于Calanus物种的准确鉴定,分析其在温带至北极海洋生态系统中的种群结构与动态
  • 物种杂交检测: 通过诊断性核标记识别Calanus物种间的杂交个体及亲本来源
  • 基因组转录组数据分析: 利用提供的基因组和转录组Contigs序列,开展Calanus物种的分子进化与功能基因研究
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 169.4 MiB
最后更新 2026年1月11日
创建于 2026年1月11日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。