数据集概述
本数据集为Calanus属桡足类物种鉴定的核插入缺失标记开发相关数据,基于C. finmarchichus和C. glacialis两个近缘物种的基因组与转录组测序分析,包含12个物种特异性扩增子长度标记的开发成果,可用于Calanus属多个物种及杂交种的分子鉴定,共含5个文件。
文件详解
- Msat_Genotypes_SuppInfo.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:未提供具体字段信息,推测包含微卫星基因型相关的补充信息
- Cgla_Transcriptome_Contigs.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:C. glacialis转录组组装的Contigs序列文件
- Cgla_Genome_Contigs.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:C. glacialis基因组组装的Contigs序列文件
- Cfin_Transcriptome_Contigs.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:C. finmarchichus转录组组装的Contigs序列文件
- Cfin_Genome_Contigs.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:C. finmarchichus基因组组装的Contigs序列文件
数据来源
论文“Genome- and transcriptome-assisted development of nuclear insertion/deletion markers for Calanus species (Copepoda: Calanoida) identification”
适用场景
- 海洋浮游生物分类鉴定: 利用物种特异性插入缺失标记,实现Calanus属多个物种的分子鉴定
- 海洋生态系统研究: 基于Calanus物种的准确鉴定,分析其在温带至北极海洋生态系统中的种群结构与动态
- 物种杂交检测: 通过诊断性核标记识别Calanus物种间的杂交个体及亲本来源
- 基因组转录组数据分析: 利用提供的基因组和转录组Contigs序列,开展Calanus物种的分子进化与功能基因研究