数据集概述
本数据集为R包GenomeAdmixR相关的模拟与分析文件，包含基因组进化与祖先个体模拟的代码、文档及软件包。GenomeAdmixR通过个体模型模拟混合后的基因组模式，支持选择、连锁和迁移等进化场景的模拟与分析，可用于验证理论预期、设计进化重测序（E&R）模拟等研究。
文件详解
- 软件包文件
- 文件名称：GenomeAdmixR_2.1.tar.gz
- 文件格式：GZ
- 字段映射介绍：R包压缩文件，包含GenomeAdmixR的核心代码与功能模块，用于执行基因组混合模拟
- 文档文件
- 文件名称：Supplementary_Material_2.1.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：补充材料文档，包含主文中提及的所有补充分析内容
- 代码文件
- 文件名称：code_Figure_3.R、Figure_2_ancestry.R、Figure_2_sequence.R、scripts_figure_4.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：共4个R脚本文件，分别用于生成主文中图2、图3、图4的模拟及绘图，包含进化重测序（E&R）模拟设计、祖先模式分析等功能代码
- 压缩文件
- 文件名称：junctions.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：与连锁理论验证相关的压缩文件，用于验证混合后局部祖先变化的分析场景
- 说明文件
- 文件名称：README
- 文件格式：无扩展名
- 字段映射介绍：数据集说明文档，概述文件用途，包括图2、图3的代码说明、R包介绍及补充材料说明
适用场景
- 基因组混合模拟研究: 利用GenomeAdmixR包模拟种群/物种杂交后的基因组镶嵌模式，分析局部祖先变化规律
- 进化重测序（E&R）设计: 通过模拟验证E&R实验的设计方案与预期结果
- 连锁理论验证: 利用junctions相关文件验证混合后连锁模式的分析预期
- 选择对局部祖先的影响研究: 模拟选择压力下基因组混合后的祖先模式变化，探索选择与祖先模式的关系
- 生物信息学方法开发: 基于GenomeAdmixR的个体模型框架，开发新的基因组进化模拟与分析方法
