数据集概述
本数据集是Gene Expression Omnibus（GEO）平台上与神经退行性或感染性疾病相关的转录组研究集合，包含研究编号、疾病类型、技术平台、样本类型、PubMed ID、对照样本及扰动样本等核心信息，部分文件含Wikidata ID映射。数据集由4个文件组成，支持生物医学领域的疾病相关基因表达研究。
文件详解
- 原始数据文件
- 文件名称：Studies on GEO related to neurogeneration or infections diseases. - original.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含Study（GEO研究编号）、Disease（疾病类型）、Platform（技术平台）、Sample type（样本类型）、PMID（PubMed ID）、Control sample（对照样本标签）、Perturbed sample（扰动样本标签）字段。
- 含Wikidata映射的TSV文件
- 文件名称：Studies on GEO related to neurogeneration or infections diseases (with Wikidata) - wikidata_reconciled.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：在原始字段基础上新增Disease_QID、PMID_QID等Wikidata ID映射字段。
- 原始Excel文件
- 文件名称：Studies on GEO related to neurogeneration or infections diseases..xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：内容与原始TSV文件一致，格式为Excel。
- 含Wikidata映射的Excel文件
- 文件名称：Studies on GEO related to neurogeneration or infections diseases (with Wikidata).xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：内容与含Wikidata映射的TSV文件一致，格式为Excel。
数据来源
Gene Expression Omnibus（GEO）平台
适用场景
- 疾病转录组研究: 分析神经退行性或感染性疾病相关的基因表达模式。
- 生物医学数据整合: 结合Wikidata ID进行跨数据库的疾病与基因信息关联分析。
- 医学文献关联研究: 通过PMID链接对应学术文献，支撑疾病机制的文献计量分析。
- 样本类型对比分析: 比较不同样本类型（如PBMC、CD14+单核细胞）在疾病研究中的应用价值。
