数据集概述
本数据集为PCSK9水平Meta-GWAS的汇总统计数据,基于固定效应模型分析。包含他汀调整后欧洲人群、未接受他汀治疗的欧洲人群全基因组数据,以及未接受他汀治疗的非洲裔美国人PCSK9基因位点的位点层面数据,共2个文件。
文件详解
- 文件名称:SummaryStatistics_PCSK9.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含markername(标记名)、chr(染色体)、bp_hg19(hg19参考基因组碱基位置)、ea(效应等位基因)、oa(其他等位基因)、eaf(效应等位基因频率)、info(所有研究的最小信息评分)、nSamples(每个SNP的样本量)、nStudies(研究数量)、beta(效应估计值)、se(标准误)、p(p值)、I2(研究间SNP异质性)、phenotype(表型设置)字段
- 文件名称:SummaryStatistics_PCSK9_SexStratified.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含与上述文件一致的字段,为按性别分层的统计数据
数据来源
论文“Meta-GWAS of PCSK9 levels detects two novel loci at APOB and TM6SF2”
适用场景
- 基因组学研究: 分析PCSK9水平相关的基因位点及遗传效应
- 药物遗传学研究: 探索他汀治疗对欧洲人群PCSK9水平的遗传影响差异
- 人群遗传学分析: 比较欧洲人群与非洲裔美国人PCSK9基因位点的遗传特征
- 心血管疾病研究: 基于PCSK9水平遗传数据,研究其与心血管疾病的关联机制