数据集概述
本数据集为水稻白叶枯病新抗性基因Xa43(t)的鉴定分析数据，包含GWAS分析、QTL定位相关的基因型与表型数据。通过F2和BC2F2群体研究，定位到qBB11位点，解析候选基因表达差异，开发特异性分子标记，支持水稻抗病育种应用。
文件详解
- ICIM genotype data RiceF2P8.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：水稻F2群体P8的ICIM基因型数据，用于QTL定位分析的遗传标记信息
- GAPIT_trait core 120.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：GAPIT分析用的核心性状数据，包含120个样本的表型测量值
- GAPIT_mdp_genotype_test.hmp.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：GAPIT分析用的基因型测试数据，包含rs编号、等位基因、染色体位置、样本基因型等信息（如JM001-JM020等样本的标记数据）
- ICIM phenotype data RiceF2P8IP.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：水稻F2群体P8的ICIM表型数据，记录白叶枯病抗性相关的表型观测值
数据来源
论文“A novel resistance gene for bacterial blight in rice, Xa43(t) identified by GWAS and confirmed by QTL mapping using a bi-parental population”
适用场景
- 水稻抗病基因功能研究: 分析Xa43(t)基因的表达模式与白叶枯病抗性机制
- 分子标记辅助育种: 利用基因特异性标记开展水稻白叶枯病抗性品种选育或基因聚合
- 数量性状位点定位: 通过F2群体基因型与表型数据验证qBB11位点的遗传效应
- 全基因组关联分析: 使用GWAS数据挖掘水稻白叶枯病抗性相关的分子标记
