数据集概述
本数据集为GxE（基因-环境互作）研究论文配套数据，包含RIL群体的基因型数据、表型数据及天气数据，共14个文件，以CSV格式为主，涵盖标记信息、性状指标、气象参数等内容，用于支持基因与环境互作相关分析。
文件详解
- 基因型数据文件
- 文件名称：如N12_genotype.csv、N18_genotype.csv、N11_genotype.csv等
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含Marker（标记）、Chrom（染色体）、Position（位置）及多个样本（如N00_HITOMEBORE、N12_URASAN等）的基因型信息
- 表型与环境数据文件
- 文件名称：如Pheno_and_env_2018.csv、Pheno_and_env_2019.csv、GN_data_3rd_year_for_R.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含id（编号）、Location（地点）、HD（抽穗期）、GN（粒数）等表型指标，以及mean_temp（平均温度）、precipitation（降水量）等环境参数
- 天气数据文件
- 文件名称：Fukushima_weather.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含福岛地区的气象相关数据（具体字段以实际文件为准）
- 结果压缩文件
- 文件名称：raw_GxE_results.zip、raw_GWAS_results.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含原始GxE分析结果和GWAS分析结果（具体内容需解压后查看）
数据来源
GxE论文配套数据集（Dataset of GxE paper）
适用场景
- 基因环境互作分析: 利用基因型、表型和天气数据，研究基因与环境因素对性状的联合影响
- 数量遗传学研究: 分析RIL群体的遗传结构与表型变异的关系
- 农业性状改良研究: 探索环境因子（如温度、降水）对作物性状的调控机制
- 生物信息学分析: 支持GWAS（全基因组关联分析）及相关统计模型验证
- 基因型表型关联研究: 挖掘标记位点与目标性状的关联关系
