Ha等人关于生物防治线虫感染灰田蛞蝓的微生物组动态研究数据产品

数据集概述

该数据集是Ha等人关于生物防治线虫(Phasmarhabditis hermaphrodita)感染灰田蛞蝓的微生物组动态研究的数据产品,包含处理后的微生物组数据文件及补充材料,支持相关微生物组结构与变化的分析。

文件详解

该数据集包含处理后数据文件和补充材料,具体说明如下: - 处理后数据产品: - ASV_sequences.fasta:FASTA格式,包含样本中所有ASV的序列数据 - ASV_table_Decontam_TrueSamples.rds:RDS格式,包含去污染后非对照样本的ASV丰度phyloseq对象 - asv_table.txt:TXT格式,包含去污染和子集化前的原始ASV丰度数据 - rooted_tree.nwk:NWK格式,包含现有分类群的系统发育树 - sample_data.txt:TXT格式,包含所有样本(对照与非对照)的元数据映射 - taxonomy_tab.tsv:TSV格式,包含ASV与分类学注释的匹配信息 - 补充材料: - Supplementary material.pdf:PDF格式,补充材料文档 - Data_Products.zip:ZIP格式,数据产品压缩包

适用场景

  • 微生物组研究:分析生物防治线虫感染过程中蛞蝓微生物组的结构变化
  • 生物防治机制研究:探究线虫感染对宿主微生物组的影响机制
  • 微生物分类学分析:基于ASV序列与系统发育树开展分类群多样性研究
  • 生态学数据分析:结合样本元数据研究微生物组与实验处理的关联
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 1.17 MiB
最后更新 2025年12月14日
创建于 2025年12月14日
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