找到8个数据集

标签: phyloseq对象

过滤结果
  • 稳健的微生物组聚类分析_自动化识别微生物群落亚群的输出结果

    2026年1月29日 30 62 37

    数据集概述 本数据集是应用R软件(robust-clustering-metagenomics)对4个已发表的纵向微生物组数据集进行稳健子状态聚类分析的输出结果,包含不同分类单元子集(如优势/非优势 taxa、属水平聚合)的聚类文件,支持微生物组动态模式及状态转换的研究。 文件详解 根目录文件 文件名称:readme.txt 文件格式:TXT...
    packageimg
  • Microbiota_profile_Based_猪脐带血微生物群研究工作流数据

    2026年1月19日 30 140 123

    数据集概述 本数据集围绕猪脐带血微生物群研究工作流构建,包含从采样、DNA提取到生物信息学分析的相关数据,涉及13份脐带血样本和2份阴性对照样本的微生物群特征,同时记录了实验过程中的污染物考量,为研究猪脐带血微生物群提供结构化数据支持。 文件详解 Ps_umbilical.rds 文件格式:RDS...
    packageimg
  • URT_微生物组_家畜暴露_基于荷兰山羊养殖户与农村居民鼻咽和口咽微生物组的过滤数据

    2026年1月18日 30 1 0

    数据集概述 本数据集包含荷兰山羊养殖户与农村居民的鼻咽(NP)和口咽(OP)微生物组数据,以phyloseq S4对象形式提供,包含扩增子序列变体(ASV)表、分类学表和样本元数据。数据经DADA2 pipeline处理及去污染、低质量样本过滤,最终保留904个NP样本和1046个OP样本,支持微生物组关联分析。 文件详解...
    packageimg
  • Supplementary_Data_Code_Using_eDNA_海带养殖对沉积物影响研究_补充数据

    2026年1月1日 30 45 16

    数据集概述 本数据集为论文“Using eDNA tools to examine the impact of kelp farming on underlying sediments”的补充数据与代码,包含33个文件,涉及海带养殖区沉积物的eDNA元数据、相关性分析结果、碳计算数据、dPCR数据及分析代码等,用于支持海带养殖对底层沉积物影响的研究。...
    packageimg
  • 昆虫后代微生物组与家庭生活及镉摄入关联研究数据集

    2025年12月20日 30 97 84

    数据集概述 本数据集包含社会性昆虫后代微生物组研究的相关数据,涉及家庭生活方式、镉摄入剂量对微生物组的影响,包含样本信息、分析脚本、序列数据及补充材料,支持研究结果复现。 文件详解 样本信息文件: cd_data.txt:TXT格式,包含样本ID、家族、镉处理剂量(0、25或100mg/L)、若虫社会环境(隔离、同胞、家庭)等变量信息 分析脚本文件:...
    packageimg
  • Ha等人关于生物防治线虫感染灰田蛞蝓的微生物组动态研究数据产品

    2025年12月14日 30 47 13

    数据集概述 该数据集是Ha等人关于生物防治线虫(Phasmarhabditis hermaphrodita)感染灰田蛞蝓的微生物组动态研究的数据产品,包含处理后的微生物组数据文件及补充材料,支持相关微生物组结构与变化的分析。 文件详解 该数据集包含处理后数据文件和补充材料,具体说明如下: - 处理后数据产品: -...
    packageimg
  • PIANO_NAZIONALE_FoodMicrobionet_5_1_1_mindata_食品微生物组研究完整数据

    2025年12月14日 30 184 176

    数据集概述 本数据集为FoodMicrobionet v5.1.1版本的mindata文件压缩包,包含可通过NCBI登录号访问单个研究信息的R列表对象,每个对象集成研究信息、样本数据及分类学相关标识,支持微生物组数据分析。 文件详解 文件名称: mindata_FMBN.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容结构:...
    packageimg
  • 植物物种丰富度与根系经济空间驱动土壤真菌群落数据集

    2025年12月12日 30 181 179

    数据集概述 本数据集围绕植物多样性、根系性状与土壤真菌群落的关系展开,包含2021年于耶拿实验中收集的样地性状数据及真菌群落特征数据,为研究植物与土壤真菌的相互作用提供支持。 文件详解 文件名称: Metadata.pdf,格式为PDF,提供数据集的元数据信息,包括实验背景、数据收集方法等说明 文件名称:...
    packageimg